RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000073961.7

Ptpre-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpre, Length 5,410 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm14214V9GX35 225 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Baz2aQ91YE5 1889 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 RttnQ8R4Y8 2226 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 P01638 115 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 NrepQ07475 68 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Khdc1cQ4KL78 166 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Srsf7Q8BL97 267 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tmem101Q91VP7 257 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Vmn1r54Q9EPB8 315 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Vmn1r1E9PVR6 306 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ascl2O35885 263 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Efnb1P52795 345 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Sdr39u1Q5M8N4 308 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Slc35d2Q762D5 326 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 OstcQ78XF5 149 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Iglv3A0A0B4J1K5 122 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Igkv6-14A0A140T8P1 115 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Smr2O09133 150 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Zfp72Q0VFY0 435 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Lcn2P11672 200 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ripply2Q2WG76 128 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr491Q8VG06 310 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Necap2Q9D1J1 266 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Wipf3P0C7L0 485 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 MymxQ2Q5T5 84 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Hyls1Q9CXX0 307 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Zfp983E9PUT0 460 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Zfp977L7N2E7 438 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Wisp1O54775 367 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Adra2aQ01338 450 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Q8CF25 301 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Znf319Q9ERR8 581 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trdv2-1A0A0G2JGB9 116 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm19345G3UYD9 124 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gata2O09100 480 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tmem95P0DJF3 176 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 HrkP62816 92 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm45871A0A1B0GRI9 540 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Mob4Q6PEB6 225 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Cox6cQ9CPQ1 76 aa14.65□□□□□ -0.06
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trbv17A0A140T8P8 114 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr364-ps1A0A140T8Q2 307 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm17727E9Q4V7 109 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr1380Q7TQT5 311 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Zfpl1Q9DB43 310 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Lhx2Q9Z0S2 406 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Adrb3P25962 400 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trav6d-4Q5R1I0 115 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Zic3Q62521 466 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Klhdc1Q80YG3 406 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm21616B6ZB74 166 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 P01801 115 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Fgf5P15656 264 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 C1ql4Q4ZJM9 238 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Q8VC23 124 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 St6galnac6Q9JM95 333 aa14.64□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ighv1-15A0A0A6YXA5 117 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Q8BTC1 67 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 SprnQ8BWU1 147 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Prss29Q99MS4 279 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ndufa7Q9Z1P6 113 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Znf329Q6GQR8 522 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr761Q7TRJ0 323 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Dtx2Q8R3P2 619 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 D130052B06RikQ3UW13 202 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Prr23a3Q9CWP9 254 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Prss22Q9ER10 306 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm21983D6RFS9 131 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trav16nA0A075B634 117 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tmem100Q9CQG9 134 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Spcs1Q9D958 161 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Arpc1aQ9R0Q6 370 aa14.63□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Derl1Q99J56 251 aa14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Hcfc2Q9D968 241 aa14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Scn10aQ6QIY3 1958 aa14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Gm20219A0A1B0GRQ3 87 aa14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 NgfP01139 241 aa14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Igkv14-100A0A0G2JG36 117 aa14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Hist1h2bfP10853 126 aa14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Trdv4Q5R1A3 115 aa14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Hist1h2bbQ64475 126 aa14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Hist1h2bkQ8CGP1 126 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Hist1h2bpQ8CGP2 126 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Rnase2aQ8K196 155 aa14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 NmbQ9CR53 121 aa14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 IcosQ9WVS0 200 aa14.62□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Dock6Q8VDR9 2080 aa14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tmprss12Q3V0Q7 336 aa14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Hist3h2bbQ8CGP0 126 aa14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Hist3h2baQ9D2U9 126 aa14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 1700015F17RikD3YUK8 150 aa14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tmem40Q4FJU9 225 aa14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Wdr83osQ6ZWX0 106 aa14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Znf474Q6V5K9 347 aa14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ss18l1Q8BW22 402 aa14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Q9CQM1 111 aa14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Tmem29A2ANF5 204 aa14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Olfr235E9Q9Z6 312 aa14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ca2P00920 260 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Ptpre-201ENSMUST00000073961 Ighv5-9A0A075B5Q2 117 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33 ms