RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579358.1

MKS1-208, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 4

Gene MKS1, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-208ENST00000579358 JPT2Q9H910 190 aa6.93□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 MUC4Q99102 2169 aa6.92□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.92□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 F2Z2F3 143 aa6.92□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 EREGO14944 169 aa6.92□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 RAB14P61106 215 aa6.92□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 CACNG7P62955 275 aa6.92□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 CT83Q5H943 113 aa6.92□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.92□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 Q6ZR54 194 aa6.92□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 LINC01551Q86U37 167 aa6.92□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.91□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 A0A087WWL8 130 aa6.91□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 C9JQL5 133 aa6.91□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 GZMBP10144 247 aa6.91□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 CTRLP40313 264 aa6.91□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 TIRAPP58753 221 aa6.91□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.91□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 AP1S3Q96PC3 154 aa6.91□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 TPPP3Q9BW30 176 aa6.91□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.9□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 LINC00694P0DN24 101 aa6.9□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 TTC32Q5I0X7 151 aa6.9□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 CLLU1Q5K131 121 aa6.9□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 WDR73Q6P4I2 378 aa6.9□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 Q6ZSN1 163 aa6.9□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 CNFNQ9BYD5 112 aa6.9□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 Q9H8V8 135 aa6.9□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 NAT8Q9UHE5 227 aa6.9□□□□□ -1.3
MKS1-208ENST00000579358 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 A8MWL6 223 aa6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 M0R2N4 97 aa6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 ERVFC1-1P60608 527 aa6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 RAB4BP61018 213 aa6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 IFITM2Q01629 132 aa6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 OSTCQ9NRP0 149 aa6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.89□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 FAM231BA6NCW3 169 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 GAGE12JA6NER3 117 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 SIVA1O15304 175 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 TRGC1P0CF51 173 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 SMIM17P0DL12 118 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 GAGE1Q13065 139 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 GAGE4Q13068 117 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 GAGE5Q13069 117 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 ZNF56Q15929 161 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 GAGE13Q4V321 117 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 ISOC2Q96AB3 205 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.88□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 NTF3P20783 257 aa6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 LINC00315P59091 139 aa6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 SSTP61278 116 aa6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 TSKUQ8WUA8 353 aa6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 GTSF1Q8WW33 167 aa6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.87□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 K7EP13 123 aa6.86□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 ADIRFQ15847 76 aa6.86□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 LELP1Q5T871 98 aa6.86□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.86□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.86□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 V9GYV3 84 aa6.86□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 F5H697 171 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 EVI2AP22794 236 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 UBE2D3P61077 147 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 UBE2D2P62837 147 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 TWIST1Q15672 202 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 C6orf223Q8N319 242 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 BORCS7Q96B45 105 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 Q9UF83 564 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 NACAE9PAV3 2078 aa6.85□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.84□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 A0A087WWC5 75 aa6.84□□□□□ -1.31
MKS1-208ENST00000579358 HIGD1CA8MV81 97 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms