RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	S100P	P25815	95 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	COX19	Q49B96	90 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	MUC4	Q99102	2169 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		A0A1B0GUT8	65 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	RHOD	O00212	210 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SPINK4	O60575	86 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	HTN1	P15515	57 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SLA	Q13239	276 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		H3BVH4	76 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	GNRH2	O43555	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	AZU1	P20160	251 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	RIG	Q13278	110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		U3KQK5	164 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	PPP1R17	O96001	155 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	MT-ND6	P03923	174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		Q6ZQT7	251 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		A0A0J9YWU9	116 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		H3BNG1	76 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965		H7C1H1	209 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	ATP5G1	P05496	136 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	NTF3	P20783	257 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TCTA	P57738	103 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	DAD1	P61803	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	HBB	P68871	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TWIST1	Q15672	202 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CHP1-208	ENST00000560965	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965		A0A1B0GXF2	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965		M0R381	172 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	RS1	O15537	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	PPBP	P02775	128 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	GZMB	P10144	247 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	RAB4B	P61018	213 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	ELOB	Q15370	118 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965		Q6ZTI0	123 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	PHOX2A	O14813	284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	GAGE7	O76087	117 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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