RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa12.23□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 OVOL2Q9BRP0 275 aa12.22□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNFNQ9BYD5 112 aa12.22□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa12.22□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa12.22□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GUT8 65 aa12.21□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNURFLB1AK76 121 aa12.21□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCO1O75880 301 aa12.21□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 CACNG7P62955 275 aa12.21□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPATA25Q9BR10 227 aa12.21□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa12.2□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL17DQ8TAD2 202 aa12.2□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTH2Q96A98 100 aa12.2□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 TM2D3Q9BRN9 247 aa12.2□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa12.19□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa12.19□□□□□ -0.46
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RIGQ13278 110 aa12.19□□□□□ -0.46
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFP82Q8N141 532 aa12.19□□□□□ -0.46
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TOP3BP1-201ENST00000420768 B9D2Q9BPU9 175 aa12.19□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLAC8L1A1L4L8 177 aa12.18□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0R2P5 195 aa12.18□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 NXPH4O95158 308 aa12.18□□□□□ -0.46
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10AG1Q8NH19 301 aa12.18□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 YPEL4Q96NS1 127 aa12.18□□□□□ -0.46
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa12.17□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa12.17□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC21A0A140T8X8 626 aa12.17□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 M0R381 172 aa12.17□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPINK4O60575 86 aa12.17□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 S100A8P05109 93 aa12.17□□□□□ -0.46
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF876PQ49A33 203 aa12.17□□□□□ -0.46
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZMAT4Q9H898 229 aa12.17□□□□□ -0.46
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NOTCH1P46531 2555 aa12.16□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa12.16□□□□□ -0.46
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GXF2 115 aa12.16□□□□□ -0.46
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM210BQ96KR6 192 aa12.15□□□□□ -0.46
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM15Q7Z3B0 74 aa12.14□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa12.13□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa12.13□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 COLCA2A8K830 154 aa12.13□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAMPP49913 170 aa12.13□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 AP1S3Q96PC3 154 aa12.13□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 MSRB1Q9NZV6 116 aa12.13□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 A8MWV9 139 aa12.12□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 GATD1Q8NB37 220 aa12.12□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM191AQ9H0A3 160 aa12.12□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.11□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZTI0 123 aa12.11□□□□□ -0.47
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C18orf15Q96N68 181 aa12.1□□□□□ -0.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 HLA-DQA1P01909 254 aa12.09□□□□□ -0.47
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CIDEAO60543 219 aa12.08□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAGE7O76087 117 aa12.08□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAGE12FP0CL80 117 aa12.08□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAGE12GP0CL81 117 aa12.08□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAGE12IP0CL82 117 aa12.08□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.08□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM136Q6ZRR5 245 aa12.08□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.08□□□□□ -0.48
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