RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292393.9

ZNF3-201, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF3, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-201ENST00000292393 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.78□□□□□ -1
ZNF3-201ENST00000292393 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.78□□□□□ -1
ZNF3-201ENST00000292393 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.78□□□□□ -1
ZNF3-201ENST00000292393 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.78□□□□□ -1
ZNF3-201ENST00000292393 ZFP82Q8N141 532 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 IL17DQ8TAD2 202 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 C16orf74Q96GX8 76 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 SPXQ9BT56 116 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 MDFICQ9P1T7 246 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.77□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 SPINK4O60575 86 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 HLA-DQA1P01909 254 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 HTN1P15515 57 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 NTF3P20783 257 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 RRN3P1Q2M238 152 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 SYT8Q8NBV8 401 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 RNF183Q96D59 192 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 RCHY1Q96PM5 261 aa8.76□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 TWIST1Q15672 202 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.75□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 SNURFLB1AK76 121 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 K7EIL1 84 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 M0R2P5 195 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 SPRY2O43597 315 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 TRGC1P0CF51 173 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 AZU1P20160 251 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 CAMPP49913 170 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 DEFB135Q30KP9 77 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 X6R8D5 127 aa8.74□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 M0R381 172 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 MIFP14174 115 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 AP1S3Q96PC3 154 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.73□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 PRM2P04554 102 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 RAB4BP61018 213 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 ZNF876PQ49A33 203 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 RASL10AQ92737 203 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.72□□□□□ -1.01
ZNF3-201ENST00000292393 PHOX2AO14813 284 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 APCSP02743 223 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 TRGC2P03986 189 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 OR11H2Q8NH07 326 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 FRZBQ92765 325 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 DNHD1Q96M86 4753 aa8.71□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 A8MWV9 139 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 SLAQ13239 276 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.7□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 EVI2AP22794 236 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 SSTP61278 116 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 Q8NAQ8 132 aa8.69□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 LYRM9A8MSI8 78 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 RS1O15537 224 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 CIDEAO60543 219 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 PPBPP02775 128 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 SMIM17P0DL12 118 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 RAB4AP20338 218 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 AMN1Q8IY45 258 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 RNF185Q96GF1 192 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 C18orf15Q96N68 181 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 U3KQK5 164 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 NOTCH1P46531 2555 aa8.68□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 RHODO00212 210 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 CRYGDP07320 174 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 LINC00315P59091 139 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF3-201ENST00000292393 RAB5BP61020 215 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms