RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm3685J3QPP2 205 aa23.77■■□□□ 1.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm10338K7N692 204 aa23.77■■□□□ 1.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tmem11Q8BK08 190 aa23.77■■□□□ 1.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr135Q8VEY4 312 aa23.77■■□□□ 1.4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kcnk15B2RVL1 343 aa23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gpr119Q7TQP3 335 aa23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1475Q8VEV6 314 aa23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr958Q8VEY3 312 aa23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1271Q8VG62 305 aa23.76■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv7-3A0A075B5R2 120 aa23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm21778A0A087WNP8 232 aa23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 St8sia2O35696 375 aa23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q3KQP7 184 aa23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tamm41Q3TUH1 337 aa23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chac2Q9CQG1 178 aa23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sval1Q9D2X6 151 aa23.75■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 H2al1oL7MU04 110 aa23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q497N7 227 aa23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zic4Q61467 341 aa23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 C030005K15RikQ8BQN9 115 aa23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Klre1Q8CJC7 226 aa23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spata3Q9D9T6 193 aa23.74■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm17727E9Q4V7 109 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cldn34c3J3QJW5 233 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cldn34c2J3QNM1 233 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Bcl2l11O54918 196 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cldn34c1Q8K193 234 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Shisa9Q9CZN4 424 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm8677K9J7G9 307 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lgals3P16110 264 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tnfrsf9P20334 256 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 G6pcP35576 357 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sult2a1P52843 285 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam3dP97805 223 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fthl17fQ3SXD2 176 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm5464Q3UY29 175 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 BsxQ810B3 232 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sfxn4Q925N1 313 aa23.73■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Xirp2Q4U4S6 3784 aa23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Igsf10Q3V1M1 2594 aa23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ighv1-4A0A075B5T4 117 aa23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 A0A1L1SV24 88 aa23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm14692A2BH01 229 aa23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mef2bO55087 349 aa23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lsm5P62322 91 aa23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr149Q60888 311 aa23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lpar6Q8BMC0 344 aa23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr513Q8VFZ3 309 aa23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rab40cQ8VHQ4 281 aa23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf580Q9DB38 172 aa23.72■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm8439G3UWA7 96 aa23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mmp9P41245 730 aa23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cd300eQ8K249 196 aa23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Asb13Q8VBX0 278 aa23.71■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Esp15A8R0U8 85 aa23.7■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spock3Q8BKV0 436 aa23.7■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fbxo36Q9CQ24 188 aa23.7■■□□□ 1.39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trbv31A0A075B5J5 111 aa23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trav6d-5A0A075B6B9 112 aa23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Krtap24-1G3X9A2 248 aa23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hbb-yP02104 147 aa23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prss2P07146 246 aa23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mamld1P0C6A2 803 aa23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc25a4P48962 298 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sssca1P56873 199 aa23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wfdc17Q5SSJ1 76 aa23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vdac2Q60930 295 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vmn1r54Q9EPB8 315 aa23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pxmp4Q9JJW0 212 aa23.7■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trav7-5A0A0G2JFX6 112 aa23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm10521E9PZK0 135 aa23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm21244J3QK38 227 aa23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CortP56469 109 aa23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 H2-DMb2Q31099 261 aa23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr1178Q7TR20 323 aa23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr132Q7TRI8 313 aa23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdkl3Q8BLF2 595 aa23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr136Q8VG72 312 aa23.69■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Stab1Q8R4Y4 2571 aa23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnase1P00683 149 aa23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pax1P09084 446 aa23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 FmodP50608 376 aa23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Scgb1b27Q91WB5 92 aa23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mrpl51Q9CPY1 128 aa23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pfdn1Q9CWM4 122 aa23.68■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vma21-psA0A140T8R2 101 aa23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rhox3gB9EJQ9 160 aa23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam98cE9PYD1 344 aa23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm4791J3QQ14 102 aa23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CycsP62897 105 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 RhogP84096 191 aa23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnase2aQ8K196 155 aa23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Necap1Q9CR95 275 aa23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Col6a5A6H584 2640 aa23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tex15F8VPN2 2785 aa23.67■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr267A2AM35 313 aa23.66■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Olfr62L7MU75 315 aa23.66■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Hoxd3P09027 433 aa23.66■■□□□ 1.38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nudt10P0C027 164 aa23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.3 ms