Protein–RNA interactions for Protein: O35696

St8sia2, Alpha-2,8-sialyltransferase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
St8sia2O35696 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
St8sia2O35696 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
St8sia2O35696 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
St8sia2O35696 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
St8sia2O35696 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
St8sia2O35696 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
St8sia2O35696 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
St8sia2O35696 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
St8sia2O35696 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
St8sia2O35696 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
St8sia2O35696 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
St8sia2O35696 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
St8sia2O35696 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
St8sia2O35696 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
St8sia2O35696 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
St8sia2O35696 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
St8sia2O35696 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
St8sia2O35696 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
St8sia2O35696 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
St8sia2O35696 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
St8sia2O35696 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
St8sia2O35696 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
St8sia2O35696 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
St8sia2O35696 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
St8sia2O35696 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
St8sia2O35696 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
St8sia2O35696 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
St8sia2O35696 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
St8sia2O35696 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
St8sia2O35696 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
St8sia2O35696 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
St8sia2O35696 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
St8sia2O35696 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
St8sia2O35696 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
St8sia2O35696 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
St8sia2O35696 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
St8sia2O35696 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
St8sia2O35696 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
St8sia2O35696 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
St8sia2O35696 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
St8sia2O35696 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
St8sia2O35696 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
St8sia2O35696 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
St8sia2O35696 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
St8sia2O35696 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
St8sia2O35696 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
St8sia2O35696 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
St8sia2O35696 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
St8sia2O35696 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
St8sia2O35696 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
St8sia2O35696 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
St8sia2O35696 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
St8sia2O35696 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
St8sia2O35696 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
St8sia2O35696 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
St8sia2O35696 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
St8sia2O35696 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
St8sia2O35696 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
St8sia2O35696 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
St8sia2O35696 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
St8sia2O35696 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
St8sia2O35696 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
St8sia2O35696 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
St8sia2O35696 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
St8sia2O35696 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
St8sia2O35696 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
St8sia2O35696 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
St8sia2O35696 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
St8sia2O35696 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
St8sia2O35696 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
St8sia2O35696 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
St8sia2O35696 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
St8sia2O35696 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
St8sia2O35696 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
St8sia2O35696 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
St8sia2O35696 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
St8sia2O35696 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
St8sia2O35696 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
St8sia2O35696 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
St8sia2O35696 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
St8sia2O35696 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
St8sia2O35696 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
St8sia2O35696 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
St8sia2O35696 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
St8sia2O35696 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
St8sia2O35696 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
St8sia2O35696 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
St8sia2O35696 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
St8sia2O35696 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
St8sia2O35696 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
St8sia2O35696 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
St8sia2O35696 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
St8sia2O35696 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
St8sia2O35696 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
St8sia2O35696 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
St8sia2O35696 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
St8sia2O35696 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
St8sia2O35696 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
St8sia2O35696 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
St8sia2O35696 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms