Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pfdn1Q9CWM4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pfdn1Q9CWM4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pfdn1Q9CWM4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pfdn1Q9CWM4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pfdn1Q9CWM4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Pfdn1Q9CWM4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pfdn1Q9CWM4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pfdn1Q9CWM4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pfdn1Q9CWM4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pfdn1Q9CWM4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pfdn1Q9CWM4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pfdn1Q9CWM4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pfdn1Q9CWM4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pfdn1Q9CWM4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pfdn1Q9CWM4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pfdn1Q9CWM4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pfdn1Q9CWM4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pfdn1Q9CWM4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pfdn1Q9CWM4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pfdn1Q9CWM4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pfdn1Q9CWM4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pfdn1Q9CWM4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pfdn1Q9CWM4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pfdn1Q9CWM4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pfdn1Q9CWM4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pfdn1Q9CWM4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pfdn1Q9CWM4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pfdn1Q9CWM4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pfdn1Q9CWM4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pfdn1Q9CWM4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pfdn1Q9CWM4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pfdn1Q9CWM4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pfdn1Q9CWM4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pfdn1Q9CWM4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pfdn1Q9CWM4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pfdn1Q9CWM4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pfdn1Q9CWM4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pfdn1Q9CWM4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pfdn1Q9CWM4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pfdn1Q9CWM4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pfdn1Q9CWM4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pfdn1Q9CWM4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pfdn1Q9CWM4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pfdn1Q9CWM4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pfdn1Q9CWM4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pfdn1Q9CWM4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pfdn1Q9CWM4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pfdn1Q9CWM4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pfdn1Q9CWM4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pfdn1Q9CWM4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pfdn1Q9CWM4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pfdn1Q9CWM4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pfdn1Q9CWM4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pfdn1Q9CWM4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pfdn1Q9CWM4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pfdn1Q9CWM4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pfdn1Q9CWM4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pfdn1Q9CWM4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pfdn1Q9CWM4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pfdn1Q9CWM4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pfdn1Q9CWM4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pfdn1Q9CWM4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pfdn1Q9CWM4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pfdn1Q9CWM4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pfdn1Q9CWM4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pfdn1Q9CWM4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pfdn1Q9CWM4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pfdn1Q9CWM4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pfdn1Q9CWM4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pfdn1Q9CWM4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pfdn1Q9CWM4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pfdn1Q9CWM4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pfdn1Q9CWM4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pfdn1Q9CWM4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pfdn1Q9CWM4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pfdn1Q9CWM4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pfdn1Q9CWM4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pfdn1Q9CWM4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pfdn1Q9CWM4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfdn1Q9CWM4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfdn1Q9CWM4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfdn1Q9CWM4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pfdn1Q9CWM4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pfdn1Q9CWM4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pfdn1Q9CWM4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pfdn1Q9CWM4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pfdn1Q9CWM4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pfdn1Q9CWM4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pfdn1Q9CWM4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pfdn1Q9CWM4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pfdn1Q9CWM4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pfdn1Q9CWM4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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