RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000079702.3

Cbx1-202, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm20816Q5FWD4 227 aa9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rnase11Q5GAM9 192 aa9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Foxc2Q61850 494 aa9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lcn3Q62471 182 aa9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nhlh2Q64221 135 aa9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Spcs3Q6ZWQ7 180 aa9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tmem106cQ80VP8 260 aa9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Nmes1Q810Q5 83 aa9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rab11fip5Q8R361 645 aa9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1271Q8VG62 305 aa9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cyb5bQ9CQX2 146 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gar1Q9CY66 231 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 NagkQ9QZ08 343 aa9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mpdu1Q9R0Q9 247 aa9.25□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1124A2AT86 318 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm5294J3QP53 216 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Hbb-bh0P04443 147 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ifna6P07350 189 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 ApcsP12246 224 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ntf3P20181 258 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Bmpr1bP36898 502 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Hmx3P42581 356 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 GalP47212 124 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Psg25Q497W1 475 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cnpy1Q4VAB4 94 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 C1ql4Q4ZJM9 238 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slamf7Q8BHK6 333 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rnase2aQ8K196 155 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rbpms2Q8VC52 206 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1466Q8VFW4 310 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Atp6v0bQ91V37 205 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Mus81Q91ZJ0 551 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Epdr1Q99M71 224 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ms4a6bQ99N09 244 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Atp5sQ9CRA7 200 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ceacam18Q9D871 376 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dazap1Q9JII5 406 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Eny2Q9JIX0 101 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trem3Q9JKE1 183 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Slc25a10Q9QZD8 287 aa9.24□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dnah14A0A140LIJ4 4489 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vma21-psA0A140T8R2 101 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Vmn1r232A2RTT5 351 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rnf212bD3Z423 297 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm21970F6XX07 295 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ankrd66J3QNN4 192 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm4791J3QQ14 102 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr707K7N662 307 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Sap30O88574 220 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rab3dP35276 219 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fabp6P51162 128 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ndufb6Q3UIU2 128 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tgfbr1Q64729 503 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gal3st2Q6XQH0 394 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gipc3Q8R5M0 297 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1195Q8VG21 308 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1099Q8VG37 312 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1238Q8VG59 315 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Tctex1d1Q9D5I4 173 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 EppinQ9DA01 134 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cxcr6Q9EQ16 351 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Clec6aQ9JKF4 209 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Elovl1Q9JLJ5 279 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Psmb3Q9R1P1 205 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Arl3Q9WUL7 182 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm4707V9GXN5 68 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Notch1Q01705 2531 aa9.23□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Olfr1436A0PK57 315 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 BC030500E9Q6W0 185 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Ccr6O54689 367 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 GzmfP08883 248 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Efnb2P52800 336 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dynlt3P56387 116 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Dhrs2Q149L0 282 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fthl17fQ3SXD2 176 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 CenptQ3TJM4 515 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Diras2Q5PR73 199 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Megf10Q6DIB5 1147 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Fam206aQ80ZQ9 193 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 BsxQ810B3 232 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Q8BTC1 67 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 AdtrpQ8C138 230 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rchy1Q9CR50 261 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 SNORCQ9CXL7 121 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Rab32Q9CZE3 223 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 St6galnac5Q9QYJ1 336 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 VwfQ8CIZ8 2813 aa9.22□□□□□ -0.93
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trav6-4A0A075B6B4 115 aa9.21□□□□□ -0.94
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Trav12d-1A0N8R0 115 aa9.21□□□□□ -0.94
Cbx1-202ENSMUST00000079702 4933408B17RikG3X9B4 273 aa9.21□□□□□ -0.94
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cldn34c3J3QJW5 233 aa9.21□□□□□ -0.94
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Cldn34c2J3QNM1 233 aa9.21□□□□□ -0.94
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Gm10553J3QPF1 123 aa9.21□□□□□ -0.94
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Klk1b4P00757 256 aa9.21□□□□□ -0.94
Cbx1-202ENSMUST00000079702 P01915 264 aa9.21□□□□□ -0.94
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Runx1Q03347 451 aa9.21□□□□□ -0.94
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Lclat1Q3UN02 376 aa9.21□□□□□ -0.94
Cbx1-202ENSMUST00000079702 MyocosQ3UWS6 143 aa9.21□□□□□ -0.94
Cbx1-202ENSMUST00000079702 Znf474Q6V5K9 347 aa9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68 ms