RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-201ENST00000312060 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-201ENST00000312060 XKRY2A2RUG3 117 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-201ENST00000312060 APOC4P55056 127 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-201ENST00000312060 RPS20P60866 119 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CTU2-201ENST00000312060 IL36BQ9NZH7 164 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-201ENST00000312060 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa16.15■□□□□ 0.18
CTU2-201ENST00000312060 A8MZ25 164 aa16.14■□□□□ 0.18
CTU2-201ENST00000312060 GZMBP10144 247 aa16.14■□□□□ 0.18
CTU2-201ENST00000312060 TMEM88Q6PEY1 159 aa16.14■□□□□ 0.18
CTU2-201ENST00000312060 ZNF575Q86XF7 245 aa16.14■□□□□ 0.18
CTU2-201ENST00000312060 TSKUQ8WUA8 353 aa16.14■□□□□ 0.18
CTU2-201ENST00000312060 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 C1orf158Q8N1D5 194 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 KCNS1Q96KK3 526 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 LINC01587Q99440 93 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 SMCO4Q9NRQ5 59 aa16.14■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 GRIFINA4D1Z8 144 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 CXorf65A6NEN9 183 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 CBLN2Q8IUK8 224 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 TMEM208Q9BTX3 173 aa16.13■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 TDRG1Q3Y452 100 aa16.12■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 TMEM256Q8N2U0 113 aa16.12■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 IMMP2LQ96T52 175 aa16.12■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 NEU1Q99519 415 aa16.12■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 PYGO2Q9BRQ0 406 aa16.12■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa16.12■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa16.11■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa16.11■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 GNRH2O43555 120 aa16.11■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 HTN1P15515 57 aa16.11■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 TCL1AP56279 114 aa16.11■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 GFRA4Q9GZZ7 299 aa16.11■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa16.11■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 S100PP25815 95 aa16.11■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 GTSF1Q8WW33 167 aa16.11■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 FAM231BA6NCW3 169 aa16.1■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 TYMSP04818 313 aa16.1■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 KCNIP4Q6PIL6 250 aa16.1■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa16.1■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 CBY3A6NI87 242 aa16.09■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 HIGD1CA8MV81 97 aa16.09■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 CXCL1P09341 107 aa16.09■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 NAT8BQ9UHF3 227 aa16.09■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 UBE2CO00762 179 aa16.08■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa16.08■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 LINC00467Q9BRT7 94 aa16.08■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 TPPP3Q9BW30 176 aa16.08■□□□□ 0.17
CTU2-201ENST00000312060 K7EIL1 84 aa16.08■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 ASIPP42127 132 aa16.08■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 NUP35Q8NFH5 326 aa16.08■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 A0A1W2PPQ1 181 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 PRM2P04554 102 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 PGLYRP4Q96LB8 373 aa16.07■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 IGLC6P0CF74 106 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 ELOBQ15370 118 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 DNLZQ5SXM8 178 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 TRGV11A0A075B6L2 103 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 DEFB135Q30KP9 77 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 MDFICQ9P1T7 246 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 MUC4Q99102 2169 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 H3BVH4 76 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 ARMS2P0C7Q2 107 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 LYZL1Q6UWQ5 148 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 SPINK4O60575 86 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 DEFB121Q5J5C9 76 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 BTF3L4Q96K17 158 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 F2Z2F3 143 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 AZU1P20160 251 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 Q6ZWC4 215 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 YPEL4Q96NS1 127 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 RCHY1Q96PM5 261 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-201ENST00000312060 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 OR5AL1P0C617 328 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 MED14OSP0DP75 135 aa16.02■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 MUC21A0A140T8X8 626 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 SNAI2O43623 268 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 CTRLP40313 264 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 SSTP61278 116 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 RRN3P1Q2M238 152 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 BORCS7Q96B45 105 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 RNF183Q96D59 192 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 SCRT2Q9NQ03 307 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-201ENST00000312060 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms