RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 KLKP1Q107X0 134 aa-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 Q5XG85 94 aa-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 OTUD6BQ8N6M0 293 aa-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 CLDN22Q8N7P3 220 aa-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 C5orf56Q8N8D9 126 aa-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 ISOC1Q96CN7 298 aa-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 DSCR8Q96T75 97 aa-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 EFCAB11Q9BUY7 163 aa-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TANC2Q9HCD6 1990 aa-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-0.32□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 A0A087WUJ7 227 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV4A0A0B4J268 109 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 ARL5CA6NH57 179 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 BANF1O75531 89 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 IFNA5P01569 189 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TPM3P06753 285 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 IDO1P14902 403 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 PHBP35232 272 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TPM4P67936 248 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 FAM216BQ8N7L0 139 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 OR5AK2Q8NH90 309 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 BTF3L4Q96K17 158 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 OR4C12Q96R67 309 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 BPESC1Q9GZL8 116 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 PARVBQ9HBI1 364 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 COA4Q9NYJ1 87 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 SOGA1O94964 1423 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 HERC2O95714 4834 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa-0.33□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 CEP164Q9UPV0 1460 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 C5orf58C9J3I9 102 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 C9JAW5 83 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 H7BYZ3 331 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H2BKO60814 126 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 LYPLA2O95372 231 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 IFNA14P01570 189 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 CRHP06850 196 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 HIST1H2BJP06899 126 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 NMBP08949 121 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 CXCL1P09341 107 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 GLRXP35754 106 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 CAPZBP47756 277 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 ATP5G3P48201 142 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 ARPP19P56211 112 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 SPA17Q15506 151 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 CSAG1Q6PB30 78 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 DEFB132Q7Z7B7 95 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM229BQ8NBD8 167 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 CCDC42Q96M95 316 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 HIVEP1P15822 2718 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa-0.34□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 HERC1Q15751 4861 aa-0.35□□□□□ -2.46
FAM227B-211ENST00000560557 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 NEBP20929 6669 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 PIK3C2GO75747 1445 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 TRAV5A0A0B4J249 113 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 K7ERJ3 54 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 M0R3E3 92 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 AIPO00170 330 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 TPST1O60507 370 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 CST7O76096 145 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFC2O95298 119 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 IGF2P01344 180 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 TRACP01848 142 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 APOC1P02654 83 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 MT-ND6P03923 174 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 APODP05090 189 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 FABP4P15090 132 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 SDC4P31431 198 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 CEBPGP53567 150 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 NDUFA6P56556 154 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 DNAJB13P59910 316 aa-0.35□□□□□ -2.47
FAM227B-211ENST00000560557 SPAG11BQ08648 103 aa-0.35□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms