RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517635.2

HOXA-AS2-202, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXA-AS2, Length 2,455 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-202ENST00000517635 FXYD7P58549 80 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ARPC1AQ92747 370 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PRR25Q96S07 402 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 COL12A1Q99715 3063 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 FGF6P10767 208 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 NDPQ00604 133 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ODF3BA8MYP8 253 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 LGALS9BQ3B8N2 356 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 Q8TAT8 98 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 DPF1Q92782 380 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SMKR1H3BMG3 65 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 C19orf84I3L1E1 186 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 RPL7P18124 248 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 RPS20P60866 119 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PAX8Q06710 450 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ZNF479Q96JC4 524 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 HBDP02042 147 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CACNG7P62955 275 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 IGFL4Q6B9Z1 124 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 DTX2Q86UW9 622 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 VGLL1Q99990 258 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 NPYP01303 97 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CKS2P33552 79 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SCGB2A2Q13296 93 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 TWIST1Q15672 202 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 RNF151Q2KHN1 245 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 HLA-DMBP28068 263 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 OR1N2Q8NGR9 330 aa11.73□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 M0R1W7 72 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 IGHG4P01861 327 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 IGLC6P0CF74 106 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PF4V1P10720 104 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PRTN3P24158 256 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 DYNAPQ8N1N2 210 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ATP6V0BQ99437 205 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 C7orf71A4D174 169 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CTSGP08311 255 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 TCTAP57738 103 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SEC11AP67812 179 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 VMO1Q7Z5L0 202 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ZNF575Q86XF7 245 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 VPS25Q9BRG1 176 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 RABAC1Q9UI14 185 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 IFI27L1Q96BM0 104 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CST9LQ9H4G1 147 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 THYN1Q9P016 225 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 BOD1L2Q8IYS8 172 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXA-AS2-202ENST00000517635 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 Q8N6K4 173 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 RNF185Q96GF1 192 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ORM1P02763 201 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 OCIAD2Q56VL3 154 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 A1L4Q6 167 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SCGB2A1O75556 95 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 ERCC8Q13216 396 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 GAS8-AS1O95177 125 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 BPESC1Q9GZL8 116 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 MAP1LC3AQ9H492 121 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 DKK2Q9UBU2 259 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 GAGE12BA1L429 117 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PRAC2D3DTV9 90 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 EBI3Q14213 229 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 A6NDN8 102 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 H3BRM9 83 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 EFNA4P52798 201 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 HSD52Q0P140 79 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SHISA2Q6UWI4 295 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 PCP2Q8IVA1 136 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 C18orf15Q96N68 181 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 SPXQ9BT56 116 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 CNFNQ9BYD5 112 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXA-AS2-202ENST00000517635 VPS13CQ709C8 3753 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms