RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 B4DSR2 109 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 SCGB2A1O75556 95 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CT45A10P0DMU9 189 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 LINC00694P0DN24 101 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 FXYD2P54710 66 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 HIGD1BQ9P298 99 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.04□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CACNA1DQ01668 2161 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ITPR3Q14573 2671 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ZNF137PP52743 207 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 GAGE13Q4V321 117 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 C3orf56Q8N813 242 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ABCA4P78363 2273 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 SVILO95425 2214 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 A8MWL6 223 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 FNDC10F2Z333 226 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ACTL6BO94805 426 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 MSMBP08118 114 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 AMTNQ6UX39 209 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 SPRY3O43610 288 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CRLF1O75462 422 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CSN3P07498 182 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 MYOD1P15172 320 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CD24P25063 80 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ZNF138P52744 262 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 CCL8P80075 99 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 MDFICQ9P1T7 246 aa6.03□□□□□ -1.44
USP4-211ENST00000485450 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 IGLL5B9A064 214 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LY6G6DO95868 133 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 CSN1S1P47710 185 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 K7EMI3 77 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 APOMO95445 188 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 PCP2Q8IVA1 136 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TIMD4Q96H15 378 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LY6LH3BQJ8 138 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 GCSHP23434 173 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TMEM86BQ8N661 226 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 PIFOQ8TCI5 191 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 DUX5Q96PT3 197 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.02□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.01□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 CT83Q5H943 113 aa6.01□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.01□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.01□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LINC00311Q8N616 119 aa6.01□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LINC00479Q96M42 142 aa6.01□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ZNF580Q9UK33 172 aa6.01□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 USF3Q68DE3 2245 aa6.01□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.01□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 MFAP4P55083 255 aa6.01□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.01□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 RPEQ96AT9 228 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 NABP2Q9BQ15 211 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 SPTA1P02549 2419 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GWB2 263 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 F5H768 121 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 LY6HO94772 140 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 EDN2P20800 178 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 CFAP126Q5VTH2 177 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 UBALD1Q8TB05 177 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 BAALCQ8WXS3 180 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TMEM101Q96IK0 257 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 PRSS22Q9GZN4 317 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 RNF223E7ERA6 249 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 NPIPB6E9PJ23 425 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 DUTP33316 252 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 PSMG4Q5JS54 123 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 MEIG1Q5JSS6 88 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 C1orf43Q9BWL3 253 aa6□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 HIVEP1P15822 2718 aa5.99□□□□□ -1.45
USP4-211ENST00000485450 A0A096LNJ9 63 aa5.99□□□□□ -1.45
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