RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PaxxQ8K0Y7 205 aa17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bpifa5Q9CQX3 270 aa17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcnx2Q5DU28 2122 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3045A0A1D5RMA1 209 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tppp2Q0P5Y3 170 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EtdQ80SW5 59 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pgam5Q8BX10 288 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plxdc1Q91ZV7 500 aa17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AtrxQ61687 2476 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BC053393A0A0B4J1F6 192 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r113G3UWI8 307 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8677K9J7G9 307 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01796 113 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01797 113 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01799 113 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klk1b22P15948 259 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wt1P22561 449 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chrna7P49582 502 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rab7aP51150 207 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ClcP97400 68 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr83osQ6ZWX0 106 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp459Q8BZ17 267 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mob3bQ8VE04 216 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1184Q8VG86 311 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GrhprQ91Z53 328 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ms4a4bQ9ES61 226 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnd2Q9QYM5 227 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DscamQ9ERC8 2013 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prop1P97458 223 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gfod1Q3UHD2 390 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1356Q7TQU8 320 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Exosc2Q8VBV3 293 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NanpQ9CPT3 248 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf151Q9CQ29 239 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf7Q9WTZ1 113 aa17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1191-ps1A0A1L1STD5 311 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp972A2AW65 139 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CckarO08786 436 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P04940 107 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P04941 107 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ly6c1P0CW02 131 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P18532 116 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bmpr1bP36898 502 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 StumQ0VBF8 141 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q0VG62 139 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q3U1D9 316 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AdipoqQ60994 247 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prodh2Q8VCZ9 456 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scp2d1Q9DAH1 156 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tusc2Q9WVF8 110 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NdnP25233 325 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tgfbr1Q64729 503 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr76Q8VFV2 317 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ms4a4cQ9D3F6 226 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ly96Q9JHF9 160 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prss30Q9QYZ9 310 aa17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20773A0A0A6YXW2 232 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20807A0A0A6YXX7 232 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp971A2BFG8 470 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21616B6ZB74 166 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm14288E9Q9W0 88 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20873J3QMQ9 232 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20795J3QP49 232 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21310J3QQ23 232 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp970Q08BU3 522 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21440Q3TTD8 232 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10645Q3UPY1 145 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rtl4Q3URY0 304 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vkorc1l1Q6TEK5 176 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BsxQ810B3 232 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mpdu1Q9R0Q9 247 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atoh7Q9Z2E5 149 aa17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ighv9-3A0A0B4J1J5 117 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1337A2ACY8 315 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20532G3UXR8 106 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20825J3QM67 227 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01659 112 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HexbP20060 536 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ctdsp1P58466 261 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ssty2Q149W4 227 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21394Q497R7 227 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20854Q62461 227 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MavsQ8VCF0 503 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1155Q8VFR3 314 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1453Q8VFX0 307 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rer1Q9CQU3 196 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lurap1Q9D6I9 239 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifitm7G3X9Z2 141 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col8a2P25318 699 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wnt10aP70701 417 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr141Q60880 325 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lax1Q8BHB3 407 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stard4Q99JV5 224 aa17.35■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm14412A2ARR7 526 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21882J3QN86 361 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8653K9J7G2 307 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r117L7N2C9 307 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lgals9O08573 353 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Foxh1O88621 401 aa17.34■□□□□ 0.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fgf7P36363 194 aa17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.2 ms