Protein–RNA interactions for Protein: P04940

Ig kappa chain V-VI region NQ2-17.4.1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04940 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
P04940 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P04940 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
P04940 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P04940 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
P04940 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
P04940 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
P04940 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
P04940 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
P04940 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
P04940 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P04940 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
P04940 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P04940 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
P04940 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
P04940 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P04940 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P04940 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P04940 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P04940 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
P04940 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
P04940 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
P04940 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
P04940 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
P04940 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
P04940 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P04940 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P04940 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P04940 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P04940 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P04940 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P04940 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P04940 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P04940 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P04940 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P04940 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P04940 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P04940 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
P04940 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P04940 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P04940 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P04940 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P04940 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P04940 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P04940 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P04940 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
P04940 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04940 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P04940 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P04940 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P04940 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P04940 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P04940 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P04940 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P04940 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P04940 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P04940 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P04940 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
P04940 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P04940 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P04940 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04940 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P04940 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P04940 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P04940 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
P04940 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
P04940 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P04940 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
P04940 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P04940 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P04940 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P04940 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P04940 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P04940 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P04940 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P04940 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P04940 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04940 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P04940 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04940 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P04940 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04940 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P04940 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04940 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P04940 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P04940 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P04940 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P04940 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P04940 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P04940 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P04940 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P04940 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P04940 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P04940 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P04940 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P04940 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
P04940 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04940 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P04940 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P04940 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms