Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX10

Pgam5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgam5Q8BX10 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pgam5Q8BX10 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pgam5Q8BX10 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pgam5Q8BX10 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pgam5Q8BX10 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pgam5Q8BX10 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pgam5Q8BX10 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pgam5Q8BX10 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pgam5Q8BX10 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pgam5Q8BX10 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pgam5Q8BX10 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pgam5Q8BX10 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pgam5Q8BX10 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pgam5Q8BX10 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pgam5Q8BX10 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pgam5Q8BX10 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pgam5Q8BX10 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pgam5Q8BX10 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pgam5Q8BX10 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pgam5Q8BX10 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pgam5Q8BX10 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pgam5Q8BX10 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pgam5Q8BX10 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pgam5Q8BX10 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pgam5Q8BX10 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pgam5Q8BX10 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pgam5Q8BX10 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pgam5Q8BX10 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pgam5Q8BX10 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pgam5Q8BX10 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pgam5Q8BX10 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pgam5Q8BX10 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pgam5Q8BX10 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pgam5Q8BX10 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pgam5Q8BX10 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pgam5Q8BX10 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pgam5Q8BX10 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pgam5Q8BX10 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pgam5Q8BX10 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pgam5Q8BX10 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pgam5Q8BX10 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pgam5Q8BX10 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pgam5Q8BX10 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pgam5Q8BX10 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pgam5Q8BX10 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pgam5Q8BX10 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pgam5Q8BX10 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pgam5Q8BX10 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pgam5Q8BX10 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pgam5Q8BX10 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pgam5Q8BX10 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pgam5Q8BX10 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pgam5Q8BX10 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pgam5Q8BX10 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgam5Q8BX10 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pgam5Q8BX10 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pgam5Q8BX10 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pgam5Q8BX10 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pgam5Q8BX10 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pgam5Q8BX10 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pgam5Q8BX10 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pgam5Q8BX10 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgam5Q8BX10 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgam5Q8BX10 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgam5Q8BX10 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgam5Q8BX10 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgam5Q8BX10 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgam5Q8BX10 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgam5Q8BX10 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgam5Q8BX10 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgam5Q8BX10 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgam5Q8BX10 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pgam5Q8BX10 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgam5Q8BX10 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgam5Q8BX10 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pgam5Q8BX10 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgam5Q8BX10 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgam5Q8BX10 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pgam5Q8BX10 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pgam5Q8BX10 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgam5Q8BX10 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pgam5Q8BX10 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pgam5Q8BX10 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pgam5Q8BX10 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pgam5Q8BX10 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgam5Q8BX10 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pgam5Q8BX10 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pgam5Q8BX10 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pgam5Q8BX10 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pgam5Q8BX10 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pgam5Q8BX10 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pgam5Q8BX10 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pgam5Q8BX10 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pgam5Q8BX10 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pgam5Q8BX10 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pgam5Q8BX10 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pgam5Q8BX10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pgam5Q8BX10 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pgam5Q8BX10 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pgam5Q8BX10 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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