RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Msrb2Q78J03 175 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr924Q7TRB8 308 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r230Q8R2A2 316 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr129Q8VEY1 330 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr482Q8VG03 323 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sh2d6Q9D413 297 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bola1Q9D8S9 137 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q9DAF8 208 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr926Q9EQ98 308 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NagkQ9QZ08 343 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SnapinQ9Z266 136 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5849J3QPE5 117 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lyz1P17897 148 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 G6pcP35576 357 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Npy1rQ04573 382 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TncQ80YX1 2110 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Stpg2Q8C8J0 561 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wipf1Q8K1I7 493 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eif3fQ9DCH4 361 aa16.26■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 A0A286YDM5 308 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppt1O88531 306 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cst7O89098 144 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sult2a2P50236 285 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Defa11P50709 85 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lhx4P53776 390 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bex6Q3TZW7 114 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trav8d-1Q5R1H8 112 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp663Q6NXM6 656 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrrc10Q8K3W2 274 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr639Q8VGY8 316 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxl17Q9QZN1 701 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdc34bA0A140T8I4 237 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Akirin2B1AXD8 201 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hist1h1aP43275 213 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rnase11Q5GAM9 192 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp273Q7M6W8 501 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp85Q7TMC9 473 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ap1s2Q9DB50 160 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trem3Q9JKE1 183 aa16.25■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ighv5-9A0A075B5Q2 117 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rpl31P62900 125 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NfybP63139 207 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Taar5Q5QD14 337 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ube2d2bQ6ZWY6 147 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hes7Q8BKT2 225 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr480Q8VEZ0 312 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr508Q8VG42 310 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HaghQ99KB8 309 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bpifa5Q9CQX3 270 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lypd8Q9D7S0 255 aa16.24■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm10638F6QEG2 257 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tnfaip6O08859 275 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AmelxP63277 210 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prss44Q402U7 372 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q504N7 393 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Phox2aQ62066 280 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 LgalslbQ7TPX9 165 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1202Q8VF98 309 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 4933400A11RikQ9CR52 288 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sp5Q9JHX2 398 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbp1Q9QXD6 338 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tusc2Q9WVF8 110 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 StrapQ9Z1Z2 350 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Iglv1A0A075B663 117 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r224E9PWK2 298 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tcstv1O70619 171 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr328Q5NCD3 310 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TpppQ7TQD2 218 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf146Q8BQN6 292 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr368Q8VF22 327 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1462Q8VFW3 307 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sval2Q99N75 144 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccl8Q9Z121 97 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Supt4h1bQ9Z199 117 aa16.23■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm15128A2ADW8 449 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm15080A2BI02 449 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm15093A2BI72 449 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Luzp4B1AV09 449 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm15107B1B0X0 449 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm15097E9QA14 449 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm21882J3QN86 361 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P01796 113 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P01797 113 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P01799 113 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ucp1P12242 307 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fgf8P37237 268 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dvl1P51141 695 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm15085Q62012 449 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tle4Q62441 773 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1155Q8VFR3 314 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ms4a3Q920C4 213 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem147Q9CQG6 224 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arhgef17Q80U35 2057 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ifitm5O88728 134 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CrhQ8CIT0 187 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr492Q8VFD1 314 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Glo1Q9CPU0 184 aa16.22■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ptprz1B9EKR1 2312 aa16.21■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r128L7N2B4 307 aa16.21■□□□□ 0.19
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 LoxP28301 411 aa16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.3 ms