Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
NfybP63139 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
NfybP63139 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
NfybP63139 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
NfybP63139 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
NfybP63139 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
NfybP63139 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
NfybP63139 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
NfybP63139 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,92■■□□□ 1,74
NfybP63139 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,72
NfybP63139 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
NfybP63139 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
NfybP63139 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
NfybP63139 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
NfybP63139 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
NfybP63139 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
NfybP63139 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
NfybP63139 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
NfybP63139 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
NfybP63139 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
NfybP63139 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
NfybP63139 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
NfybP63139 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
NfybP63139 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
NfybP63139 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
NfybP63139 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
NfybP63139 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
NfybP63139 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
NfybP63139 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,32■■□□□ 1,48
NfybP63139 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
NfybP63139 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
NfybP63139 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
NfybP63139 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,19■■□□□ 1,46
NfybP63139 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,18■■□□□ 1,46
NfybP63139 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
NfybP63139 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
NfybP63139 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
NfybP63139 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,15■■□□□ 1,46
NfybP63139 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
NfybP63139 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
NfybP63139 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
NfybP63139 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
NfybP63139 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
NfybP63139 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
NfybP63139 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
NfybP63139 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
NfybP63139 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,78■■□□□ 1,4
NfybP63139 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
NfybP63139 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
NfybP63139 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
NfybP63139 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
NfybP63139 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
NfybP63139 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,63■■□□□ 1,37
NfybP63139 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
NfybP63139 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,61■■□□□ 1,37
NfybP63139 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
NfybP63139 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,53■■□□□ 1,36
NfybP63139 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,44■■□□□ 1,34
NfybP63139 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
NfybP63139 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
NfybP63139 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
NfybP63139 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
NfybP63139 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
NfybP63139 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
NfybP63139 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
NfybP63139 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,14■■□□□ 1,3
NfybP63139 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,14■■□□□ 1,29
NfybP63139 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
NfybP63139 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
NfybP63139 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
NfybP63139 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
NfybP63139 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
NfybP63139 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
NfybP63139 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
NfybP63139 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
NfybP63139 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,93■■□□□ 1,26
NfybP63139 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
NfybP63139 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,86■■□□□ 1,25
NfybP63139 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
NfybP63139 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,81■■□□□ 1,24
NfybP63139 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
NfybP63139 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
NfybP63139 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
NfybP63139 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
NfybP63139 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
NfybP63139 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
NfybP63139 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
NfybP63139 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
NfybP63139 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,62■■□□□ 1,21
NfybP63139 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
NfybP63139 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
NfybP63139 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,58■■□□□ 1,2
NfybP63139 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
NfybP63139 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,53■■□□□ 1,2
NfybP63139 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
NfybP63139 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
NfybP63139 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
NfybP63139 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,5■■□□□ 1,19
NfybP63139 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
NfybP63139 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
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