Protein–RNA interactions for Protein: P17897

Lyz1, Lysozyme C-1, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyz1P17897 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Lyz1P17897 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lyz1P17897 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lyz1P17897 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lyz1P17897 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lyz1P17897 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lyz1P17897 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Lyz1P17897 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lyz1P17897 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lyz1P17897 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lyz1P17897 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Lyz1P17897 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lyz1P17897 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lyz1P17897 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lyz1P17897 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lyz1P17897 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lyz1P17897 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lyz1P17897 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lyz1P17897 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lyz1P17897 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lyz1P17897 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lyz1P17897 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lyz1P17897 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lyz1P17897 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lyz1P17897 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lyz1P17897 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lyz1P17897 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lyz1P17897 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lyz1P17897 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lyz1P17897 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lyz1P17897 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lyz1P17897 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lyz1P17897 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lyz1P17897 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lyz1P17897 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Lyz1P17897 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lyz1P17897 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lyz1P17897 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lyz1P17897 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lyz1P17897 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lyz1P17897 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lyz1P17897 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lyz1P17897 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lyz1P17897 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lyz1P17897 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lyz1P17897 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lyz1P17897 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lyz1P17897 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lyz1P17897 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lyz1P17897 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lyz1P17897 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lyz1P17897 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lyz1P17897 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lyz1P17897 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lyz1P17897 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lyz1P17897 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lyz1P17897 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lyz1P17897 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lyz1P17897 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lyz1P17897 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lyz1P17897 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lyz1P17897 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lyz1P17897 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lyz1P17897 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lyz1P17897 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lyz1P17897 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lyz1P17897 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lyz1P17897 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lyz1P17897 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lyz1P17897 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lyz1P17897 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lyz1P17897 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lyz1P17897 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lyz1P17897 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lyz1P17897 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lyz1P17897 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lyz1P17897 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lyz1P17897 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lyz1P17897 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lyz1P17897 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lyz1P17897 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lyz1P17897 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lyz1P17897 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lyz1P17897 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lyz1P17897 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lyz1P17897 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lyz1P17897 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lyz1P17897 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lyz1P17897 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lyz1P17897 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lyz1P17897 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lyz1P17897 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lyz1P17897 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lyz1P17897 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lyz1P17897 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lyz1P17897 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lyz1P17897 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lyz1P17897 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lyz1P17897 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lyz1P17897 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms