Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Eif3fQ9DCH4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Eif3fQ9DCH4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Eif3fQ9DCH4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Eif3fQ9DCH4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Eif3fQ9DCH4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Eif3fQ9DCH4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Eif3fQ9DCH4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Eif3fQ9DCH4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eif3fQ9DCH4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Eif3fQ9DCH4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Eif3fQ9DCH4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Eif3fQ9DCH4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Eif3fQ9DCH4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Eif3fQ9DCH4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Eif3fQ9DCH4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif3fQ9DCH4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif3fQ9DCH4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Eif3fQ9DCH4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Eif3fQ9DCH4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif3fQ9DCH4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Eif3fQ9DCH4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Eif3fQ9DCH4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Eif3fQ9DCH4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Eif3fQ9DCH4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Eif3fQ9DCH4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Eif3fQ9DCH4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Eif3fQ9DCH4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Eif3fQ9DCH4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Eif3fQ9DCH4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eif3fQ9DCH4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Eif3fQ9DCH4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Eif3fQ9DCH4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Eif3fQ9DCH4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Eif3fQ9DCH4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eif3fQ9DCH4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3fQ9DCH4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3fQ9DCH4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3fQ9DCH4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3fQ9DCH4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3fQ9DCH4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif3fQ9DCH4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif3fQ9DCH4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Eif3fQ9DCH4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eif3fQ9DCH4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eif3fQ9DCH4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Eif3fQ9DCH4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eif3fQ9DCH4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Eif3fQ9DCH4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Eif3fQ9DCH4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Eif3fQ9DCH4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Eif3fQ9DCH4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Eif3fQ9DCH4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Eif3fQ9DCH4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Eif3fQ9DCH4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Eif3fQ9DCH4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Eif3fQ9DCH4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Eif3fQ9DCH4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif3fQ9DCH4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eif3fQ9DCH4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Eif3fQ9DCH4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eif3fQ9DCH4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif3fQ9DCH4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3fQ9DCH4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3fQ9DCH4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Eif3fQ9DCH4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Eif3fQ9DCH4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3fQ9DCH4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3fQ9DCH4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Eif3fQ9DCH4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3fQ9DCH4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3fQ9DCH4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3fQ9DCH4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3fQ9DCH4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3fQ9DCH4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3fQ9DCH4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eif3fQ9DCH4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eif3fQ9DCH4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Eif3fQ9DCH4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3fQ9DCH4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eif3fQ9DCH4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3fQ9DCH4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Eif3fQ9DCH4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Eif3fQ9DCH4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Eif3fQ9DCH4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Eif3fQ9DCH4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Eif3fQ9DCH4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Eif3fQ9DCH4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Eif3fQ9DCH4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Eif3fQ9DCH4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Eif3fQ9DCH4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Eif3fQ9DCH4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Eif3fQ9DCH4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Eif3fQ9DCH4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Eif3fQ9DCH4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eif3fQ9DCH4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Eif3fQ9DCH4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Eif3fQ9DCH4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms