Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SnapinQ9Z266 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SnapinQ9Z266 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SnapinQ9Z266 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SnapinQ9Z266 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SnapinQ9Z266 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SnapinQ9Z266 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SnapinQ9Z266 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnapinQ9Z266 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SnapinQ9Z266 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SnapinQ9Z266 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SnapinQ9Z266 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SnapinQ9Z266 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SnapinQ9Z266 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SnapinQ9Z266 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SnapinQ9Z266 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SnapinQ9Z266 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SnapinQ9Z266 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SnapinQ9Z266 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnapinQ9Z266 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SnapinQ9Z266 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SnapinQ9Z266 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SnapinQ9Z266 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SnapinQ9Z266 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnapinQ9Z266 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SnapinQ9Z266 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SnapinQ9Z266 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SnapinQ9Z266 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SnapinQ9Z266 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SnapinQ9Z266 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnapinQ9Z266 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SnapinQ9Z266 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnapinQ9Z266 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnapinQ9Z266 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnapinQ9Z266 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SnapinQ9Z266 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SnapinQ9Z266 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SnapinQ9Z266 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SnapinQ9Z266 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnapinQ9Z266 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnapinQ9Z266 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnapinQ9Z266 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnapinQ9Z266 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SnapinQ9Z266 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnapinQ9Z266 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnapinQ9Z266 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnapinQ9Z266 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnapinQ9Z266 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SnapinQ9Z266 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnapinQ9Z266 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SnapinQ9Z266 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnapinQ9Z266 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnapinQ9Z266 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SnapinQ9Z266 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnapinQ9Z266 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SnapinQ9Z266 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SnapinQ9Z266 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SnapinQ9Z266 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SnapinQ9Z266 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SnapinQ9Z266 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SnapinQ9Z266 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SnapinQ9Z266 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnapinQ9Z266 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnapinQ9Z266 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SnapinQ9Z266 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SnapinQ9Z266 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SnapinQ9Z266 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SnapinQ9Z266 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SnapinQ9Z266 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SnapinQ9Z266 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SnapinQ9Z266 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SnapinQ9Z266 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SnapinQ9Z266 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnapinQ9Z266 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SnapinQ9Z266 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnapinQ9Z266 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnapinQ9Z266 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnapinQ9Z266 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnapinQ9Z266 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnapinQ9Z266 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SnapinQ9Z266 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SnapinQ9Z266 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnapinQ9Z266 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SnapinQ9Z266 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SnapinQ9Z266 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SnapinQ9Z266 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnapinQ9Z266 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SnapinQ9Z266 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SnapinQ9Z266 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SnapinQ9Z266 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnapinQ9Z266 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SnapinQ9Z266 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SnapinQ9Z266 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SnapinQ9Z266 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnapinQ9Z266 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SnapinQ9Z266 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SnapinQ9Z266 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SnapinQ9Z266 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnapinQ9Z266 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SnapinQ9Z266 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms