RNA–Protein interactions for RNA: YMR135W-A

YMR135W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR135W-A, Length 534 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR135W-AYMR135W-A APE1P14904 514 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A PWP1P21304 576 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A RIT1P23796 513 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A UGA3P26370 528 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A RMA1P36001 430 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A CCT7P42943 550 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YFL054CP43549 646 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YNR071CP53757 342 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A HDA1P53973 706 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A ADA2Q02336 434 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A FDC1Q03034 503 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A GYL1Q04322 720 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A GAD1Q04792 585 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A RSF1Q05043 376 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A AAD4Q07747 329 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A RSB1Q08417 382 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A THI21Q08975 551 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A NMD4Q12129 218 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A GET3Q12154 354 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A NBP2Q12163 236 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A GRX6Q12438 231 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YOL159C-AQ3E769 90 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A CHD1P32657 1468 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A TPK1P06244 397 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A PPQ1P32945 549 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A STB6P36085 766 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A AKL1P38080 1108 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A MSC7P38694 644 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A GND1P38720 489 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A FSH1P38777 243 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YHR131CP38835 850 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A FLC2P39719 783 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data5.8□□□□□ -1.48not detected
YMR135W-AYMR135W-A ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YPR196WQ06595 470 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YOR111WQ99210 232 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YMR084WA2P2R3 262 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A PRC1P00729 532 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A BIK1P11709 440 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A CLB1P24868 471 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A RPC82P32349 654 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A SWH1P35845 1188 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A APE3P37302 537 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A SIF2P38262 535 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data5.79□□□□□ -1.48not detected
YMR135W-AYMR135W-A FMP10P40098 244 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A PRK1P40494 810 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A GCD10P41814 478 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A THI6P41835 540 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A BST1P43571 1029 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A NOP9P47077 666 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A DSD1P53095 428 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A JJJ1P53863 590 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YMR210WQ03649 449 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A GIS4Q04233 774 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.79□□□□□ -1.48not detected
YMR135W-AYMR135W-A RCN2Q12044 265 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A SAC3P46674 1301 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A RPS9AO13516 197 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A NOT3P06102 836 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A SNF5P18480 905 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A ARP2P32381 391 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A MRP20P32387 263 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A GYP6P32806 458 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A MAC1P35192 417 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A LYS9P38999 446 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YIL161WP40449 235 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A NAS2P40555 220 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YJR098CP47139 656 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A MNP1P53163 194 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A SNF12P53628 566 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A TOF1P53840 1238 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A LEE1Q02799 301 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YPS7Q06325 596 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A CRD1Q07560 283 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YOR022CQ12204 715 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A YLL054CQ12244 843 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A COX17Q12287 69 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR135W-AYMR135W-A TUB2P02557 457 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A CMP2P14747 604 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A OM45P16547 393 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data5.77□□□□□ -1.49not detected
YMR135W-AYMR135W-A PRP28P23394 588 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A IMG2P25642 146 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A PEP3P27801 918 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A POA1P38218 177 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A SMF1P38925 575 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A BUD16P39988 312 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A MET18P40469 1032 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A CEP3P40969 608 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A SSU1P41930 458 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A ZIM17P42844 174 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A GCV2P49095 1034 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A TNA1P53322 534 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A ACS1Q01574 713 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A NGL3Q03210 505 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A YAP6Q03935 383 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A RCO1Q04779 684 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR135W-AYMR135W-A STP4Q07351 490 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.1 ms