RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	EHT1	P38295	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	PCI8	P40512	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	YPT10	P38146	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	HXT7	P39004	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	YGR153W	P48238	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	MTC7	P32633	139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	ASK1	P35734	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	BRN1	P38170	754 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	SPC97	P38863	823 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	JHD1	P40034	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	OPT1	P40897	799 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	ARR3	Q06598	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	AIM41	Q12032	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	CRC1	Q12289	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSI1	YMR025W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	SFP1	P32432	683 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	CCL1	P37366	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	YHR033W	P38690	423 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	YDL183C	P48569	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	WAR1	Q03631	944 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	USA1	Q03714	838 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	LRO1	P40345	661 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	TDA10	P42938	290 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	ECM9	Q02202	377 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	PCL8	Q08966	492 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	OAF3	P36023	863 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	PXL1	P36166	706 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	FAT1	P38225	669 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	VID28	P40547	921 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	YHM2	Q04013	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	CDC26	P14724	124 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	SAE2	P46946	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
CSI1	YMR025W	HMG2	P12684	1045 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
CSI1	YMR025W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	HFI1	Q12060	488 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	TPO3	Q06451	622 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CSI1	YMR025W	YPR089W	O13585	888 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YJL193W	P39542	402 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	ALG12	P53730	551 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	HER1	Q12276	1246 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	APM4	Q99186	491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YIL024C	P40543	189 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	HRD3	Q05787	833 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YTA7	P40340	1379 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	AAC1	P04710	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	VPS33	P20795	691 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	THI73	Q07904	523 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	ADR1	P07248	1323 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YIL092W	P40497	633 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	HLJ1	P48353	224 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	DNM1	P54861	757 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	ENT2	Q05785	613 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	BI2	P03873	423 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	MGM1	P32266	881 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	DGR2	P32330	852 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	PPG1	P32838	368 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	IRC7	P43623	340 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	NUP53	Q03790	475 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	CYK3	Q07533	885 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CSI1	YMR025W	GCS1	P35197	352 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CSI1	YMR025W	MNN1	P39106	762 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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