RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A ARR3Q06598 404 aa3.46□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A YCG1Q06680 1035 aa3.46□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A CDC26P14724 124 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A DHR2P36009 735 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A APD1P38281 316 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A VID28P40547 921 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A OPT1P40897 799 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A SCW4P53334 386 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A ORC1P54784 914 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A DNM1P54861 757 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A WAR1Q03631 944 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A YHM2Q04013 314 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data3.45□□□□□ -1.86not detected
YMR001C-AYMR001C-A YLR111WQ12528 110 aa3.45□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A YMR084WA2P2R3 262 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A YMR085WP0CF18 432 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A YAP1P19880 650 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A CAP1P28495 268 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A EUG1P32474 517 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A OAF3P36023 863 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A TYS1P36421 394 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A LRO1P40345 661 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A ALG12P53730 551 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A IDP3P53982 420 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A BSP1Q06604 576 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A PCL8Q08966 492 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A AIM41Q12032 185 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A TGS1Q12052 315 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A RDL1Q12305 139 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A ADR1P07248 1323 aa3.44□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A GSY2P27472 705 aa3.43□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A PPG1P32838 368 aa3.43□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A CCL1P37366 393 aa3.43□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A BRN1P38170 754 aa3.43□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A MNT3P40549 630 aa3.43□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A GFD1Q04839 188 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A HFI1Q12060 488 aa3.43□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A HMG2P12684 1045 aa3.42□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A RGT1P32862 1170 aa3.42□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A LOT5P34234 306 aa3.42□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A JHD1P40034 492 aa3.42□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A SAE2P46946 345 aa3.42□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A HLJ1P48353 224 aa3.42□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A RNH70P53331 553 aa3.42□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A USA1Q03714 838 aa3.42□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A THI73Q07904 523 aa3.42□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A CRC1Q12289 327 aa3.42□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A YTA7P40340 1379 aa3.41□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A TSR4P25040 408 aa3.41□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.41□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A ASK1P35734 292 aa3.41□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A RMA1P36001 430 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A MNN1P39106 762 aa3.41□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A PCI8P40512 444 aa3.41□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A TDA10P42938 290 aa3.41□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A HER1Q12276 1246 aa3.41□□□□□ -1.86
YMR001C-AYMR001C-A YPK1P12688 680 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data3.4□□□□□ -1.87not detected
YMR001C-AYMR001C-A RRP14P36080 434 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A PXL1P36166 706 aa3.4□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A GZF3P42944 551 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A TPO3Q06451 622 aa3.4□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A VPS33P20795 691 aa3.39□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YJU2P28320 278 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YJL193WP39542 402 aa3.39□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YIL024CP40543 189 aa3.39□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YPL071CQ02864 156 aa3.39□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A HRD3Q05787 833 aa3.39□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YPR089WO13585 888 aa3.38□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A PCK1P10963 549 aa3.38□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A DGR2P32330 852 aa3.38□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A AHA1Q12449 350 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A APM4Q99186 491 aa3.38□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YER190C-BP0CX94 160 aa3.37□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YEL077W-AP0CX95 160 aa3.37□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YGR296C-BP0CX96 160 aa3.37□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YPL283W-BP0CX97 160 aa3.37□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YPR204C-AP0CX98 160 aa3.37□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A ATP12P22135 325 aa3.37□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A HXT4P32467 576 aa3.37□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A SPC97P38863 823 aa3.37□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A FLO5P38894 1075 aa3.37□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A MNN11P46985 422 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A AAC1P04710 309 aa3.36□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A SQS1P53866 767 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A CYK3Q07533 885 aa3.36□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A NGL1Q08213 363 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A BET2P20133 325 aa3.35□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A DAL3P32459 195 aa3.35□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A DSS4P32601 143 aa3.35□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A SER1P33330 395 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A DID4P36108 232 aa3.35□□□□□ -1.87
YMR001C-AYMR001C-A YIL092WP40497 633 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.1 ms