RNA–Protein interactions for RNA: YML078W

CPR3, Transcript of Mitochondrial peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR3, Length 549 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR3	YML078W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	YFT2	Q06676	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	CDA2	Q06703	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	DCG1	P32460	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	LST4	P34239	828 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	CDS1	P38221	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	COS111	P38308	924 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	FMO1	P38866	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	ELO3	P40319	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	HOS4	P40480	1083 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	CAB2	P40506	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	YIL077C	P40508	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	TEL2	P53038	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	VID22	Q05934	901 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	YLR358C	O13565	187 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	TUP1	P16649	713 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
CPR3	YML078W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	RIT1	P23796	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	BCS1	P32839	456 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	YBR053C	P38235	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	REV7	P38927	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	VFA1	P40080	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	POL31	P46957	487 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	MUP1	P50276	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	TRS31	Q03337	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	ADY4	Q05955	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	TMA10	Q06177	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	TFC6	Q06339	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	CTT1	P06115	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	VPS33	P20795	691 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	SWC3	P31376	625 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	YBR138C	P38277	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	YJL193W	P39542	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	BST1	P43571	1029 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	BNA1	P47096	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	UBC11	P52492	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	ATG21	Q02887	496 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	MED1	Q12321	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	LAS17	Q12446	633 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPR3	YML078W	INH1	P01097	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	SIR3	P06701	978 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	BET2	P20133	325 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	VPS34	P22543	875 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	MAC1	P35192	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	BCD1	P38772	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	YER010C	P40011	234 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	LRO1	P40345	661 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	YAP1802	P53309	568 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	ACS1	Q01574	713 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	ABF1	P14164	731 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	YCR015C	P25616	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	CBF2	P32504	956 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	PAH1	P32567	862 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	TOD6	P34219	525 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	FMP52	P40008	231 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	RFX1	P48743	811 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	SEM1	O94742	89 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	TPK1	P06244	397 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	DSS4	P32601	143 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	CNS1	P33313	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	CTP1	P38152	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	IFA38	P38286	347 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	EHT1	P38295	451 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	AXL2	P38928	823 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	TMN3	P40071	706 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	YJL163C	P46996	555 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	MPS3	P47069	682 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	BUL1	P48524	976 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	AIM6	Q07716	390 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	NBP2	Q12163	236 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CPR3	YML078W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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