RNA–Protein interactions for RNA: YLR345W

YLR345W, Transcript of Similar to 6-phosphofructo-2-kinase enzymes, yeast

Gene YLR345W, Length 1,530 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR345W	YLR345W	EMP65	P40085	556 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	YIP4	P53093	235 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	VPS5	Q92331	675 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	ARG1	P22768	420 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	MAD2	P40958	196 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	PEX8	P53248	589 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	SND1	Q04007	877 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	YDL121C	Q07541	149 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	HOP1	P20050	605 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	DPB3	P27344	201 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	STL1	P39932	569 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	YEL025C	P39991	1188 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	MFM1	Q02783	413 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	SPO11	P23179	398 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	CWH43	P25618	953 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	YIL092W	P40497	633 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	HOL1	P53389	586 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	YNR071C	P53757	342 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	DIN7	Q12086	430 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	MPD2	Q99316	277 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YLR345W	YLR345W	URA3	P03962	267 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	TPK2	P06245	380 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	PCK1	P10963	549 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	VPS33	P20795	691 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	PEX2	P32800	271 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	BUD17	P53727	317 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	ARO10	Q06408	635 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	YJL193W	P39542	402 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	NUR1	Q12066	484 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	RPN13	O13563	156 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	CNE1	P27825	502 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	YMC1	P32331	307 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	ATF1	P40353	525 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	YGL117W	P53133	265 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	MDR1	P53258	950 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	PSF3	Q12146	194 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	PHO3	P24031	467 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	ERP2	P39704	215 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	PAC2	P39937	518 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	MRK1	P50873	501 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	GIS1	Q03833	894 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	HOF1	Q05080	669 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	NKP1	Q12493	238 aa		5	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	THI6	P41835	540 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	USA1	Q03714	838 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	ARG7	Q04728	441 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	DSS4	P32601	143 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	STB5	P38699	743 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	IMA5	P40884	581 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
YLR345W	YLR345W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	YPT10	P38146	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	SAP4	P53036	818 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	CPR8	P53728	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	ULA1	Q12059	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	HOS1	Q12214	470 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	ADH4	P10127	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	TGL1	P34163	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	RIM4	P38741	713 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLR345W	YLR345W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLR345W	YLR345W	CBP3	P21560	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR345W	YLR345W	NIC96	P34077	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR345W	YLR345W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLR345W	YLR345W	GSM1	P42950	618 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.1 ms