RNA–Protein interactions for RNA: YKL007W

CAP1, Transcript of Alpha subunit of the capping protein heterodimer (Cap1p and Cap2p), yeast

Gene CAP1, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CAP1	YKL007W	YMC1	P32331	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	YBR071W	P38243	211 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	YJL193W	P39542	402 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	HOL1	P53389	586 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	HOF1	Q05080	669 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	ARR3	Q06598	404 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	VPS5	Q92331	675 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	WHI2	P12611	486 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	VPS33	P20795	691 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	ATP12	P22135	325 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	CWH43	P25618	953 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	DAL3	P32459	195 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	PAF1	P38351	445 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	IRC5	P43610	853 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	YDL183C	P48569	320 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	COQ6	P53318	479 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	ARG7	Q04728	441 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	THI7	Q05998	598 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	TSR4	P25040	408 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	CCL1	P37366	393 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	YEL076C	P39971	216 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	MDR1	P53258	950 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	BUD17	P53727	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	SEG1	Q04279	960 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	PEX15	Q08215	383 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	OSW1	Q08692	278 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	TMA17	Q12513	150 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	MRC1	P25588	1096 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	AAD3	P25612	363 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	EHT1	P38295	451 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CAP1	YKL007W	KAR1	P11927	433 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	PMA2	P19657	947 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	YNL018C	P53976	612 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	USA1	Q03714	838 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	BET2	P20133	325 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	DSS4	P32601	143 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	STL1	P39932	569 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	OPT1	P40897	799 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	COG6	P53959	839 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	IRC3	Q06683	689 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	HOS1	Q12214	470 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	ERG11	P10614	530 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	PCK1	P10963	549 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	RPC34	P32910	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	LTP1	P40347	161 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	TAX4	P47030	604 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	RIM13	Q03792	727 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	ORM2	Q06144	216 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	CBP3	P21560	335 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	MRPL9	P31334	269 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	HOT13	P36078	116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	APD1	P38281	316 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	SAP4	P53036	818 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	MNT2	P53059	558 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	AAC1	P04710	309 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	MDM10	P18409	493 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	TAF5	P38129	798 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	YJR120W	P47157	116 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	PEX14	P53112	341 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	PHM6	Q05637	104 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	CRT10	Q08226	957 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	SLX4	Q12098	748 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	PSF3	Q12146	194 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	APN1	P22936	367 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	PTP1	P25044	335 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	YPT10	P38146	199 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	EAF5	P39995	279 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	WAR1	Q03631	944 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	TRI1	Q05024	226 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	AFT2	Q08957	416 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CAP1	YKL007W	NUP1	P20676	1076 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CAP1	YKL007W	ARG1	P22768	420 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CAP1	YKL007W	PLC1	P32383	869 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CAP1	YKL007W	TFC4	P33339	1025 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CAP1	YKL007W	SDS22	P36047	338 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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