RNA–Protein interactions for RNA: YJR083C

ACF4, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene ACF4, Length 930 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACF4	YJR083C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	HOL1	P53389	586 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	FOL1	P53848	824 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	MFM1	Q02783	413 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	FMP30	Q02883	468 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	RGT2	Q12300	763 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	STE12	P13574	688 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	NUP1	P20676	1076 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	YEL076C	P39971	216 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	TRS23	Q03784	219 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	PHM6	Q05637	104 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	VPS5	Q92331	675 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	SEC12	P11655	471 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	YUR1	P26725	428 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	MTC7	P32633	139 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	CDS1	P38221	457 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	EHT1	P38295	451 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	ATG36	P46983	293 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	SNF12	P53628	566 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ACF4	YJR083C	PHO5	P00635	467 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	PLC1	P32383	869 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	MRPL7	P36519	292 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	YMC2	P38087	329 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	RIM4	P38741	713 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	PIH1	P38768	344 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	IRC5	P43610	853 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	YIP4	P53093	235 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	PEF1	P53238	335 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	TPK2	P06245	380 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	CWH43	P25618	953 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	LOT5	P34234	306 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	YJL193W	P39542	402 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	STL1	P39932	569 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	EAF5	P39995	279 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	MPS1	P54199	764 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	YDL073W	Q07454	984 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	HOS1	Q12214	470 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	PCK1	P10963	549 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	VPS33	P20795	691 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	APN1	P22936	367 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	YMC1	P32331	307 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	TOM20	P35180	183 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	MIT1	P40002	666 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	LRO1	P40345	661 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	YDL183C	P48569	320 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	BUD17	P53727	317 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	YOR378W	Q08902	515 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	TGS1	Q12052	315 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	SLX4	Q12098	748 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	PSF3	Q12146	194 aa		3.56	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	STE4	P18851	423 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	HOP1	P20050	605 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	SAW1	P39735	261 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	MNT2	P53059	558 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	ZPS1	Q12512	249 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	PHO3	P24031	467 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	CNE1	P27825	502 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	DSS4	P32601	143 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	GRX7	P38068	203 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	TAF5	P38129	798 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	YIL092W	P40497	633 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	TAX4	P47030	604 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	ARR3	Q06598	404 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	ULA1	Q12059	462 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	BET2	P20133	325 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	ARG1	P22768	420 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	SDS22	P36047	338 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	CCL1	P37366	393 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	STB2	P46679	850 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	CPR8	P53728	308 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	NUR1	Q12066	484 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ACF4	YJR083C	WHI2	P12611	486 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ACF4	YJR083C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
ACF4	YJR083C	YGL117W	P53133	265 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ACF4	YJR083C	COQ6	P53318	479 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ACF4	YJR083C	YNR071C	P53757	342 aa		3.52	□□□□□ -1.85
ACF4	YJR083C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
ACF4	YJR083C	SND1	Q04007	877 aa		3.52	□□□□□ -1.85

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.9 ms