RNA–Protein interactions for RNA: YHR177W

YHR177W, Transcript of Putative transcription factor containing a WOPR domain, yeastyeast

Gene YHR177W, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR177WYHR177W FUM1P08417 488 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W CMP2P14747 604 aa5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data5.33□□□□□ -1.56not detected
YHR177WYHR177W IME1P21190 360 aa5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SIR1P21691 654 aa5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SGF29P25554 259 aa5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W AAD3P25612 363 aa5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W ESL2P36168 1195 aa5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W PSF2P40359 213 aa5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W AXL1P40851 1208 aa5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SET2P46995 733 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YDR131CQ03899 556 aa5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W TMA10Q06177 86 aa5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W GPB1Q08886 897 aa5.33□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W MET17P06106 444 aa5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W ADE3P07245 946 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W CDC6P09119 513 aa5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W POL3P15436 1097 aa5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W NPL6P32832 435 aa5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W DEF1P35732 738 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W BYE1P36106 594 aa5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SRP72P38688 640 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W PPE1P38796 400 aa5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YML6P51998 286 aa5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YLR345WQ06137 509 aa5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W PGC1Q08959 321 aa5.32□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W ARG3P05150 338 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W RED1P14291 827 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W BET2P20133 325 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W MTC7P32633 139 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W ORC2P32833 620 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W RPT3P33298 428 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SEC27P41811 889 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W PSP1P50896 841 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W DUS1P53759 423 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W ACS1Q01574 713 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YML122CQ03207 126 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YMR155WQ03795 547 aa5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W URA3P03962 267 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W PDX1P16451 410 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W RIT1P23796 513 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W POA1P38218 177 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W RFC5P38251 354 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W MIP6P38760 659 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W CHS7P38843 316 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W POP2P39008 433 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W RRT14P40470 206 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SAP4P53036 818 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W DUO1P53168 247 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data5.3□□□□□ -1.56not detected
YHR177WYHR177W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SMC6Q12749 1114 aa5.3□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W CKA1P15790 372 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W DGR2P32330 852 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SRP101P32916 621 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W PHO23P50947 330 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YNL058CP53947 316 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W TIM50Q02776 476 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SES1P07284 462 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W ROX1P25042 368 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W RAI1P53063 387 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YSA1Q01976 231 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YMR210WQ03649 449 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YPL191CQ08930 360 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W OSW2Q12202 724 aa5.29□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W CPA2P03965 1118 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W PMA1P05030 918 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W HSF1P10961 833 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W ARG1P22768 420 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YKR075CP36155 307 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YLF2P38746 405 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YHR218WP38899 603 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W PSD1P39006 500 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W JEM1P40358 645 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SIP4P46954 829 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W VPS62P53285 467 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W VPS75P53853 264 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W NGL3Q03210 505 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W GRX3Q03835 250 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W YCG1Q06680 1035 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W CEX1Q12453 761 aa5.28□□□□□ -1.56
YHR177WYHR177W SUI3P09064 285 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YHR177WYHR177W FBP1P09201 348 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR177WYHR177W RPC82P32349 654 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR177WYHR177W CTF13P35203 478 aa5.27□□□□□ -1.57
YHR177WYHR177W RMA1P36001 430 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.1 ms