RNA–Protein interactions for RNA: YHR067W

HTD2, Transcript of Mitochondrial 3-hydroxyacyl-thioester dehydratase, yeast

Gene HTD2, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HTD2	YHR067W	PHO3	P24031	467 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	NIC96	P34077	839 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	YJL193W	P39542	402 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	YIL166C	P40445	542 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	THI6	P41835	540 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	YIP4	P53093	235 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	YNR071C	P53757	342 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	STE12	P13574	688 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	HOP1	P20050	605 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	MUP3	P38734	546 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	YEL020C	P39994	560 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	HOS1	Q12214	470 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	SEC12	P11655	471 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	TGL1	P34163	548 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	SAW1	P39735	261 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HTD2	YHR067W	RPN13	O13563	156 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	CBP3	P21560	335 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	SPO11	P23179	398 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	CNE1	P27825	502 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	DSS4	P32601	143 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	PPZ2	P33329	710 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	SDS22	P36047	338 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	ASK10	P48361	1146 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	BUD17	P53727	317 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	TPK2	P06245	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	ADH4	P10127	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	ADY2	P25613	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	PIH1	P38768	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	MET14	Q02196	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	HOF1	Q05080	669 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	STB5	P38699	743 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	GSM1	P42950	618 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	YJR008W	P47085	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	USA1	Q03714	838 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	BNR1	P40450	1375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	GAL1	P04385	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	YKL133C	P36066	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	CCL1	P37366	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	TAF5	P38129	798 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	RIM4	P38741	713 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	SWD1	P39706	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	IMA5	P40884	581 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	GIS1	Q03833	894 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	TRI1	Q05024	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	ARP7	Q12406	477 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	ATP4	P05626	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	MRK1	P50873	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	YGL117W	P53133	265 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	CPR8	P53728	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	ARO10	Q06408	635 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	MLC2	Q06580	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	TGS1	Q12052	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	NYV1	Q12255	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	BET2	P20133	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	YMC1	P32331	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	LOT5	P34234	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	FLO10	P36170	1169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	PAC2	P39937	518 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	PIP2	P52960	996 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	COS12	P53053	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	ACS1	Q01574	713 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	PTP2	P29461	750 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	YPT10	P38146	199 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	YLF2	P38746	405 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	HIS6	P40545	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	MAD3	P47074	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	SAP4	P53036	818 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	COQ6	P53318	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HTD2	YHR067W	ARG7	Q04728	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.4 ms