RNA–Protein interactions for RNA: YGL057C

GEP7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene GEP7, Length 864 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GEP7	YGL057C	HOT13	P36078	116 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	UBP12	P39538	1254 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	LRO1	P40345	661 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	COQ6	P53318	479 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	SKY1	Q03656	742 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	ARR3	Q06598	404 aa		5.04	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	LOT5	P34234	306 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	PEA2	P40091	420 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	ATG36	P46983	293 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	PIP2	P52960	996 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GEP7	YGL057C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	WHI2	P12611	486 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	PEF1	P53238	335 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	YNL018C	P53976	612 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	TGS1	Q12052	315 aa		5.02	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	VPS33	P20795	691 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	AEP2	P22136	580 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	APN1	P22936	367 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	MBR1	P23493	339 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	YJL193W	P39542	402 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	YEN1	P40028	759 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	LTP1	P40347	161 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	YLR464W	P0CX17	216 aa		5	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	EUG1	P32474	517 aa		5	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	CCL1	P37366	393 aa		5	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	YEL076C	P39971	216 aa		5	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	XBP1	P40489	647 aa		5	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	IRC5	P43610	853 aa		5	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	NIT2	P47016	307 aa		5	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	TRE2	Q08693	809 aa		5	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	PTP1	P25044	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	SAP4	P53036	818 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	USA1	Q03714	838 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	PCK1	P10963	549 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	GLO1	P50107	326 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	SPC105	P53148	917 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	MDR1	P53258	950 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	VPS5	Q92331	675 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	SEC12	P11655	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	RPC34	P32910	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	YFL015C	P43578	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	YJL043W	P47053	257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	ORM2	Q06144	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	ICT1	Q12385	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GEP7	YGL057C	CWH43	P25618	953 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	DSS4	P32601	143 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	GRX4	P32642	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	TMT1	P32643	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	YPT10	P38146	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	NET1	P47035	1189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	ATP23	P53722	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	IRC3	Q06683	689 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	YAP7	Q08182	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	YBR071W	P38243	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	EAF5	P39995	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	MNT2	P53059	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	SLD3	P53135	668 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	TMA17	Q12513	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	BET2	P20133	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	MRPL9	P31334	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	WAR1	Q03631	944 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	ARG1	P22768	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	APD1	P38281	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	EMP65	P40085	556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	OPT1	P40897	799 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	YJR120W	P47157	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	HOL1	P53389	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	SEC5	P89102	971 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
GEP7	YGL057C	PCL8	Q08966	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	AAC1	P04710	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	EXO1	P39875	702 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	PEX15	Q08215	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	FRE7	Q12333	620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	KAR1	P11927	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GEP7	YGL057C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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