RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W KTR4P38131 464 aa6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W MAL33P38157 468 aa6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W DUN1P39009 513 aa6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W MEF2P39677 819 aa6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W YER130CP39959 443 aa6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W CTH1P47976 325 aa6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W ENP2P48234 707 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W VPS62P53285 467 aa6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W RXT3Q07458 294 aa6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W PGA3Q12746 312 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W YLR415CO13578 112 aa6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W TUB3P09734 445 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W PHO81P17442 1178 aa6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W DGR2P32330 852 aa6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W YKL222CP35995 705 aa6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W SRP68P38687 599 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W MSS4P38994 779 aa6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W GID8P40208 455 aa6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W YPT11P48559 417 aa6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W EXG2P52911 562 aa6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W PIB2P53191 635 aa6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W OMS1Q06668 471 aa6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W CTI6Q08923 506 aa6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W CDC6P09119 513 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W CDC26P14724 124 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W DEP1P31385 405 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W HXT4P32467 576 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W LIP5P32875 414 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W APT2P36973 181 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W SIC1P38634 284 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W YHL017WP38745 532 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W SAW1P39735 261 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W QRI7P43122 407 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W IES1P43579 692 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W YGL082WP53155 381 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W MRPL22P53881 309 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W GCN5Q03330 439 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W DUS4Q06063 367 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W PSR2Q07949 397 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W VHS3Q08438 674 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W YOL114CQ12322 202 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W NPC2Q12408 173 aa5.99□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W PET111P08468 800 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W MSS18P08593 268 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W HOP1P20050 605 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W PRP4P20053 465 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W ADE2P21264 571 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W GSY2P27472 705 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W POL12P38121 705 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W YBR259WP38338 688 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W NOC2P39744 710 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W ASK10P48361 1146 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W ARG5,6Q01217 863 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W WAR1Q03631 944 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W YAP6Q03935 383 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W VPS64Q03944 604 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W COG4Q06096 861 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W YPS7Q06325 596 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W MCM21Q06675 368 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W NUR1Q12066 484 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W NKP1Q12493 238 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W DFG16Q99234 619 aa5.98□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W MATALPHA2P0CY08 210 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W HMLALPHA2P0CY09 210 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data5.97□□□□□ -1.45not detected
VHS1YDR247W PHO3P24031 467 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W CLB1P24868 471 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W PET127P32606 800 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W APL2P36000 726 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W SDS22P36047 338 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W ECM1P39715 212 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W STL1P39932 569 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W ACA1P39970 489 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W EAF5P39995 279 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W IRC5P43610 853 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W REC102Q02721 264 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W SGO1Q08490 590 aa5.97□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W APA1P16550 321 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W DBF20P32328 564 aa5.96□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W SPC110P32380 944 aa5.96□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W MF(ALPHA)2P32435 120 aa5.96□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W SAP185P40856 1058 aa5.96□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W STP4Q07351 490 aa5.96□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W TLG2Q08144 397 aa5.96□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W PSF3Q12146 194 aa5.96□□□□□ -1.45
VHS1YDR247W SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YEL076C-AP0CX16 216 aa5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W YLR464WP0CX17 216 aa5.95□□□□□ -1.46
VHS1YDR247W FRS1P15624 595 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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