RNA–Protein interactions for RNA: Q0017

Q0017, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0017, Length 162 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0017	Q0017	TSR4	P25040	408 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	SFP1	P32432	683 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	MTC7	P32633	139 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	APD1	P38281	316 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	BSP1	Q06604	576 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	YCG1	Q06680	1035 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	EUG1	P32474	517 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	LOT5	P34234	306 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	OAF3	P36023	863 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	FAT1	P38225	669 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	VID28	P40547	921 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	ECM9	Q02202	377 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	YHM2	Q04013	314 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	AIM41	Q12032	185 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	YLR111W	Q12528	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0017	Q0017	MNT3	P40549	630 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	YDL183C	P48569	320 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	ALG12	P53730	551 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	ARR3	Q06598	404 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	PCL8	Q08966	492 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	TGS1	Q12052	315 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	GSY2	P27472	705 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	YPT10	P38146	199 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	LRO1	P40345	661 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	OPT1	P40897	799 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
Q0017	Q0017	CRC1	Q12289	327 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	YTA7	P40340	1379 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	CDC26	P14724	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	CCL1	P37366	393 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	BRN1	P38170	754 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	JHD1	P40034	492 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	PCI8	P40512	444 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	WAR1	Q03631	944 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	ADR1	P07248	1323 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	HMG2	P12684	1045 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	ASK1	P35734	292 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	HFI1	Q12060	488 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	TDA10	P42938	290 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	USA1	Q03714	838 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	PPG1	P32838	368 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	SAE2	P46946	345 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	HLJ1	P48353	224 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	DNM1	P54861	757 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	THI73	Q07904	523 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Q0017	Q0017	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
Q0017	Q0017	SPC97	P38863	823 aa		4.71	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	TPO3	Q06451	622 aa		4.71	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	HER1	Q12276	1246 aa		4.71	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	MNN1	P39106	762 aa		4.7	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	YJL193W	P39542	402 aa		4.7	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	RNH70	P53331	553 aa		4.7	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	YPL071C	Q02864	156 aa		4.7	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	APM4	Q99186	491 aa		4.7	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	PXL1	P36166	706 aa		4.69	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	YIL024C	P40543	189 aa		4.69	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	VPS33	P20795	691 aa		4.68	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	PCK1	P10963	549 aa		4.67	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	HXT4	P32467	576 aa		4.67	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	HRD3	Q05787	833 aa		4.67	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	CYK3	Q07533	885 aa		4.67	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	YPR089W	O13585	888 aa		4.66	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	AAC1	P04710	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	DGR2	P32330	852 aa		4.66	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
Q0017	Q0017	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Q0017	Q0017	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Q0017	Q0017	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Q0017	Q0017	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Q0017	Q0017	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Q0017	Q0017	DSS4	P32601	143 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Q0017	Q0017	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
Q0017	Q0017	YIL092W	P40497	633 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Q0017	Q0017	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
Q0017	Q0017	NUP145	P49687	1317 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Q0017	Q0017	BI2	P03873	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 238.6 ms