RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590104.1

LAMA3-211, Transcript of laminin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 5

Gene LAMA3, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 SLX4Q8IY92 1834 aa8.52□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 CENPFP49454 3210 aa8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 SRGNP10124 158 aa8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 NPR1P16066 1061 aa8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 CBLBQ13191 982 aa8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 PRR5LQ6MZQ0 368 aa8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.51□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 KCNQ3O43525 872 aa8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 PLA2G5P39877 138 aa8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 EPS15P42566 896 aa8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 HUNKP57058 714 aa8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 KCNMA1Q12791 1236 aa8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 KIF6Q6ZMV9 814 aa8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 TJP1Q07157 1748 aa8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 SPINT1O43278 529 aa8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 PARP10Q53GL7 1025 aa8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 Q6ZVU0 165 aa8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 ZBTB33Q86T24 672 aa8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 GPC2Q8N158 579 aa8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 FAM122AQ96E09 287 aa8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 NRXN2Q9P2S2 1712 aa8.49□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 RIPK4P57078 832 aa8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 KRT76Q01546 638 aa8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 DCTN1Q14203 1278 aa8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 CCDC93Q567U6 631 aa8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 VPS33BQ9H267 617 aa8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 CACNA1AO00555 2505 aa8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 HOXB7P09629 217 aa8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 RUNDC1Q96C34 613 aa8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 CSRNP1Q96S65 589 aa8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 TSPYL4Q9UJ04 414 aa8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 LAMA3Q16787 3333 aa8.47□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.46□□□□□ -1.05
LAMA3-211ENST00000590104 TBC1D8O95759 1140 aa8.46□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 CRY2Q49AN0 593 aa8.46□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 RGMBQ6NW40 437 aa8.46□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.46□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 MIS18AQ9NYP9 233 aa8.46□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 FZD9O00144 591 aa8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 CHL1O00533 1208 aa8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 SCNN1DP51172 638 aa8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF34Q8IZ26 560 aa8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LAMA3-211ENST00000590104 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms