RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 IRAK1P51617 712 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 TMC1Q8TDI8 760 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 CUL7Q14999 1698 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 WNT11O96014 354 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 AP3B2Q13367 1082 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 FBXL6Q8N531 539 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 ARID3AQ99856 593 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 RAD18Q9NS91 495 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 TOPBP1Q92547 1522 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-215ENST00000583289 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 GPR182O15218 404 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 F13BP05160 661 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 FOSL1P15407 271 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 MAP7Q14244 749 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 ABCB6Q9NP58 842 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 PAX4O43316 350 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 IGHA2P01877 340 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 ZAR1Q86SH2 424 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 FMN1Q68DA7 1419 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 CTSBP07858 339 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 CYP27A1Q02318 531 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 CSRNP1Q96S65 589 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 ADAMTS4O75173 837 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 RAB6AP20340 208 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 PDE3AQ14432 1141 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 MSMPQ1L6U9 139 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 DYMQ7RTS9 669 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 TIAM1Q13009 1591 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 CYP26A1O43174 497 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 AOC2O75106 756 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 ECEL1O95672 775 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 NFICP08651 508 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 GRM2Q14416 872 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 PRNPP04156 253 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 ADMP35318 185 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 ASPAP45381 313 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 GATA6Q92908 595 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 WDR18Q9BV38 432 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-215ENST00000583289 BRD1O95696 1058 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-215ENST00000583289 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-215ENST00000583289 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-215ENST00000583289 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-215ENST00000583289 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-215ENST00000583289 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-215ENST00000583289 FBXL18Q96ME1 805 aa6.46□□□□□ -1.38
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