RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 APOA5Q6Q788 366 aa24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 KIF18AQ8NI77 898 aa24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.87■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 IKBKBO14920 756 aa24.86■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.86■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM29Q14134 588 aa24.86■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 TMC6Q7Z403 805 aa24.86■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 AIFM3Q96NN9 605 aa24.86■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.86■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 B4E1Z4 1266 aa24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB43O43298 467 aa24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 PDE6AP16499 860 aa24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 NCAPHQ15003 741 aa24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC102BQ68D86 513 aa24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 MICU3Q86XE3 530 aa24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 AIDAQ96BJ3 306 aa24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 HPSEQ9Y251 543 aa24.85■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.84■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 RXRAP19793 462 aa24.84■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 CDC27P30260 824 aa24.84■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.84■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 TUBE1Q9UJT0 475 aa24.84■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.84■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 PHKBQ93100 1093 aa24.83■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 PTPAQ15257 358 aa24.83■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 ALX1Q15699 326 aa24.83■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.83■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PTDSS1-201ENST00000337004 PDE8AO60658 829 aa24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 PHKA1P46020 1223 aa24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNJ6P48051 423 aa24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 SHC4Q6S5L8 630 aa24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP3K14Q99558 947 aa24.82■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 FANCCQ00597 558 aa24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 NTRK3Q16288 839 aa24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 LPIN2Q92539 896 aa24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 LY9Q9HBG7 655 aa24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 LIFRP42702 1097 aa24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 ISM2Q6H9L7 571 aa24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 SENP2Q9HC62 589 aa24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 OGFRQ9NZT2 677 aa24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 PRDM4Q9UKN5 801 aa24.81■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 RESP18Q5W5W9 173 aa24.8■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.8■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 CUTAO60888 179 aa24.8■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 TUBB4AP04350 444 aa24.8■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 DMTNQ08495 405 aa24.8■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 ERO1AQ96HE7 468 aa24.8■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.8■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 CBFA2T2O43439 604 aa24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 WASF1Q92558 559 aa24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 NAPBQ9H115 298 aa24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 MYL5Q02045 173 aa24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 SLAIN2Q9P270 581 aa24.79■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP3K12Q12852 859 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 OLFM4Q6UX06 510 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 STK36Q9NRP7 1315 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 C4AP0C0L4 1744 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 C4BP0C0L5 1744 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 SPATA5Q8NB90 893 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PTDSS1-201ENST00000337004 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.1 ms