RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 SPC24Q8NBT2 197 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 SENP2Q9HC62 589 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 STK36Q9NRP7 1315 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 KINO60870 393 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 PTGS1P23219 599 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 CDC27P30260 824 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 ITPK1Q13572 414 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 DUOX1Q9NRD9 1551 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 IFNL3Q8IZI9 196 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 B4E1Z4 1266 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 CPLX1O14810 134 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 NDUFA8P51970 172 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 SIK1P57059 783 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 AIDAQ96BJ3 306 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 BPIFA3Q9BQP9 254 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 ANO10Q9NW15 660 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 SBF2Q86WG5 1849 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 SPTLC2O15270 562 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 CDKL5O76039 1030 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 MAP3K12Q12852 859 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 ANO1Q5XXA6 986 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 MAGEB6Q8N7X4 407 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 MTA3Q9BTC8 594 aa16.05■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 MBD4O95243 580 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 DDB1Q16531 1140 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC152Q4G0S7 254 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC186Q7Z3E2 898 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 TRIM5Q9C035 493 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa16.04■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 A0A1B0GVL5 298 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 ATP6V1AP38606 617 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 SLC39A14Q15043 492 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 STK38Q15208 465 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 PTPAQ15257 358 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 MAP3K14Q99558 947 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 NRBP1Q9UHY1 535 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 GNAT2P19087 354 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 CMA1P23946 247 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 AIFM3Q96NN9 605 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 CNNM2Q9H8M5 875 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 HPSEQ9Y251 543 aa16.03■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 SNAP23O00161 211 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 PPP6R2O75170 966 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC144BQ3MJ40 725 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 AKNAD1Q5T1N1 836 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 BARGINQ6ZT62 677 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 MPHOSPH8Q99549 860 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 ALG1Q9BT22 464 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 KIAA1468Q9P260 1216 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4C-201ENST00000317868 ZBTB43O43298 467 aa16.02■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 KRT40Q6A162 431 aa16.02■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 VPS37DQ86XT2 251 aa16.02■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 TIGD1Q96MW7 591 aa16.02■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 BTAF1O14981 1849 aa16.02■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 RCAN1P53805 252 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 ARMT1Q9H993 441 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 RGL2O15211 777 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 APPP05067 770 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 LCORLQ8N3X6 602 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 KRT23Q9C075 422 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 NAPBQ9H115 298 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 INCENPQ9NQS7 918 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 LY75O60449 1722 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 CTDSPL2Q05D32 466 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 CHRNDQ07001 517 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 NHSQ6T4R5 1651 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 PDCL3Q9H2J4 239 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 BCAMP50895 628 aa16■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 LRMPQ12912 555 aa16■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 CEP57L1Q8IYX8 460 aa16■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ATG4C-201ENST00000317868 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms