RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 GAKO14976 1311 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 CLRN2A0PK11 232 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 FSTL1Q12841 308 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF384Q8TF68 577 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 VEZTQ9HBM0 779 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 SULF1Q8IWU6 871 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 CDC45O75419 566 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 PDE6AP16499 860 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 CYP7A1P22680 504 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 ADD2P35612 726 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 BTDP43251 543 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 HIP1O00291 1037 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 CHMLP26374 656 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 CHGBP05060 677 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 UBE3CQ15386 1083 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXD11-201ENST00000249504 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 TNFAIP1Q13829 316 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 USP48Q86UV5 1035 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 USP40Q9NVE5 1235 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 ADM5C9JUS6 153 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 BAG3O95817 575 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 TNNI2P48788 182 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 CACNB3P54284 484 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 APPBP2Q92624 585 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 FAM227BQ96M60 508 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 PLCG2P16885 1265 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 CASC1Q6TDU7 716 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0D9SFI3 127 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 TRAF5O00463 557 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 C8orf34Q49A92 452 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 CERS3Q8IU89 383 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 OSBP2Q969R2 916 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 PASKQ96RG2 1323 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 RHBDL3P58872 404 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 PPP4CP60510 307 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 C1QTNF8P60827 252 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 TEX11Q8IYF3 940 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD11-201ENST00000249504 RAD50Q92878 1312 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 RASA3Q14644 834 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 M0R2C6 588 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 NFIAQ12857 509 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 DLK2Q6UY11 383 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 FAM83AQ86UY5 434 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 CDCA5Q96FF9 252 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 BACH2Q9BYV9 841 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 IL25Q9H293 177 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 SGSM2O43147 1006 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 TCP10Q12799 353 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 PICALMQ13492 652 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 IDI2Q9BXS1 227 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 FOCADQ5VW36 1801 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD11-201ENST00000249504 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms