RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000139005.1

Hoxd3os1-202, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd3os1, Length 1,701 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Samm50Q8BGH2 469 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Slc14a2Q8R4T9 930 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Socs7Q8VHQ2 579 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Odf2lQ9D478 642 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Syt10Q9R0N4 523 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Sh3bp5Q9Z131 463 aa14.89□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Peak1Q69Z38 1735 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Psmd14O35593 310 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Zkscan4Q5SZT6 480 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Podxl2Q8CAE9 603 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 FanclQ9CR14 375 aa14.88□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa14.87□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Zkscan2G3X952 960 aa14.87□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Il15P48346 162 aa14.87□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mkrn3Q60764 544 aa14.87□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa14.87□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pcmtd1P59913 357 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cdca7Q9D0M2 382 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Plagl1Q9JLQ4 704 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Col3a1P08121 1464 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Bin2D3Z6Q9 489 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Gpr182P43142 395 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Snx13Q6PHS6 957 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fam13aQ8BGI4 693 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ift57Q8BXG3 429 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tlcd1Q99JT6 247 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Q9D2X8 372 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tnip1Q9WUU8 647 aa14.86□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Myh15E9Q264 1925 aa14.85□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 GabreA2AMW3 916 aa14.85□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Surf1P09925 306 aa14.85□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Klra1P20937 262 aa14.85□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Casp1P29452 402 aa14.85□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 EvcP57680 1005 aa14.85□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Smc4Q8CG47 1286 aa14.85□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Shtn1Q8K2Q9 631 aa14.85□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa14.85□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Usp34Q6ZQ93 3582 aa14.84□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ccdc121E9Q6D3 323 aa14.84□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tgfb1i1Q62219 461 aa14.84□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tpm4Q6IRU2 248 aa14.84□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa14.84□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Spata16Q8C636 571 aa14.84□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Wdr24Q8CFJ9 790 aa14.84□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ints4Q8CIM8 964 aa14.84□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Stx6Q9JKK1 255 aa14.84□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 SisF8VQM5 1818 aa14.84□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tyro3P55144 880 aa14.83□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 CbarpQ66L44 698 aa14.83□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa14.83□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Adcy2Q80TL1 1090 aa14.83□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tmem67Q8BR76 992 aa14.83□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Angel2Q8K1C0 544 aa14.83□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Tmem143Q8VD26 458 aa14.83□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Osbpl5Q9ER64 874 aa14.83□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Dpp7Q9ET22 506 aa14.83□□□□□ -0.03
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa14.83□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Prl3d2F6R3P9 224 aa14.83□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Hmx1O70218 332 aa14.83□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Cpa2Q504N0 417 aa14.83□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 LratQ9JI60 231 aa14.83□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Rfc1P35601 1131 aa14.82□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 VegfbP49766 207 aa14.82□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Csrnp1P59054 583 aa14.82□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Terf1P70371 421 aa14.82□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ccdc51Q3URS9 406 aa14.82□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Fam177a1Q8BR63 207 aa14.82□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Bicd2Q921C5 820 aa14.82□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa14.82□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Chmp3Q9CQ10 224 aa14.82□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Myh4Q5SX39 1939 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1700006A11RikB9EHI3 544 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Adck5Q80V03 582 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Dhx38Q80X98 1228 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa14.81□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Kifc2O08672 792 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ftl2P49945 183 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mmp14P53690 582 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Trak2Q6P9N8 913 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Mxd3Q80US8 206 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Lrrc8aQ80WG5 810 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 MycbpQ9EQS3 103 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 Phactr2B1AVP0 632 aa14.8□□□□□ -0.04
Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 D1Pas1P16381 660 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 210.5 ms