RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Hps6Q8BLY7 805 aa22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 DymQ8CHY3 669 aa22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cyp2ab1S4R196 498 aa22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cplx2P84086 134 aa22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 HelbQ6NVF4 1074 aa22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Col23a1Q8K4G2 532 aa22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Uba5Q8VE47 403 aa22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 1700018B08RikQ9DA83 213 aa22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rcan1Q9JHG6 198 aa22.11■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm9992B2RWK3 458 aa22.1■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm3893E9Q1I1 302 aa22.1■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Bnip3O55003 187 aa22.1■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 SrprbP47758 269 aa22.1■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cnnm3Q32NY4 713 aa22.1■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Unc93aQ710D3 458 aa22.1■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Adck5Q80V03 582 aa22.1■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Plcd1Q8R3B1 756 aa22.1■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 MlphQ91V27 590 aa22.1■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Terf2ipQ91VL8 393 aa22.1■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Abl1P00520 1123 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ppfia3P60469 1194 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gja5Q01231 358 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Myl10Q62082 202 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 9230110C19RikQ8CC70 267 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Bola3Q8CEI1 110 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Bap1Q99PU7 728 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 WtapQ9ER69 396 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Epb41l3Q9WV92 929 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cdc45Q9Z1X9 566 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 LyarQ08288 388 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ubash3aQ3V3E1 624 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Krt85Q9Z2T6 507 aa22.09■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Chd5A2A8L1 1946 aa22.08■■□□□ 1.13
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cfap99A0A140LIX9 648 aa22.08■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cd22P35329 862 aa22.08■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zfp317Q8C0Q5 607 aa22.08■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Med4Q9CQA5 270 aa22.08■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa22.08■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Efcc1Q9JJF6 558 aa22.08■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Rgs12Q8CGE9 1381 aa22.08■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 CgnP59242 1191 aa22.07■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mknk2Q8CDB0 459 aa22.06■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prss40A6H6T1 365 aa22.06■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mtx1P47802 317 aa22.06■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccdc82Q6PG04 518 aa22.06■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc44a4Q91VA1 707 aa22.06■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa22.05■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gas1Q01721 343 aa22.05■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ckap2Q3V1H1 664 aa22.05■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 AsnsQ61024 561 aa22.05■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cep131Q62036 1060 aa22.05■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Otop3Q80UF9 577 aa22.05■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Terb1Q8C0V1 768 aa22.05■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Cnpy3Q9DAU1 276 aa22.05■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa22.05■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Foxp1P58462 705 aa22.04■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ppp4cP97470 307 aa22.04■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ifit1Q64282 463 aa22.04■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ttll4Q80UG8 1193 aa22.04■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Q8C6G1 249 aa22.04■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Suclg2Q9Z2I8 433 aa22.04■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Syce3B5KM66 88 aa22.03■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mum1l1Q4VA55 681 aa22.03■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Casc1Q6TDU8 730 aa22.03■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mtmr3Q8K296 1196 aa22.03■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sirt2Q8VDQ8 389 aa22.03■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Dock5B2RY04 1868 aa22.03■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atp2b4Q6Q477 1205 aa22.03■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Samm50Q8BGH2 469 aa22.03■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa22.03■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Sec23aQ01405 765 aa22.02■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa22.02■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Stn1Q8K2X3 378 aa22.02■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 SdsQ8VBT2 327 aa22.02■■□□□ 1.12
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ccdc6D3YZP9 469 aa22.01■■□□□ 1.11
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Prom2Q3UUY6 835 aa22.01■■□□□ 1.11
Ldb1-201ENSMUST00000026252 QarsQ8BML9 775 aa22.01■■□□□ 1.11
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Naa30Q8CES0 364 aa22.01■■□□□ 1.11
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Wdr24Q8CFJ9 790 aa22.01■■□□□ 1.11
Ldb1-201ENSMUST00000026252 PnnO35691 725 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Ldb1-201ENSMUST00000026252 PtmaP26350 111 aa22■■□□□ 1.11
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zscan22Q8BGS5 496 aa22■■□□□ 1.11
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Slc1a4O35874 532 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 81.2 ms