RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004201.7

Col5a3-201, Transcript of Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col5a3, Length 6,119 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sox13Q04891 613 aa16.18■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 4930548H24RikQ9D496 437 aa16.18■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 1700018F24RikB2RW27 314 aa16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rapgef1Q3UHC1 1224 aa16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 9230110C19RikQ8CC70 267 aa16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Spats2Q8K1N4 545 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cd274Q9EP73 290 aa16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Exoc3Q6KAR6 755 aa16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ubash3aQ3V3E1 624 aa16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 AU022751B1B0V2 589 aa16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 CltaO08585 235 aa16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mtx1P47802 317 aa16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Arid3aQ62431 601 aa16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Anp32cQ64G17 123 aa16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vps54Q5SPW0 977 aa16.17■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm2030D3Z7C4 212 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm6583E9Q8Z1 469 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pex1Q5BL07 1284 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Znf365Q8BG89 408 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 HgsQ99LI8 775 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Efhd1Q9D4J1 240 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Prim1P20664 417 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zbtb45Q52KG4 520 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mcm7Q61881 719 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 HscbQ8K3A0 234 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pde6cQ91ZQ1 861 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pank2Q3U4S0 443 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zmynd15Q8C0R7 736 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Becn2P0DM65 447 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ms4a1P19437 291 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 RbsnQ80Y56 783 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mlh1Q9JK91 760 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mx2Q9WVP9 655 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Leo1Q5XJE5 667 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 ParnQ8VDG3 624 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 CactinQ9CS00 772 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stx17Q9D0I4 301 aa16.16■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccdc174Q3U155 467 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 KaznQ69ZS8 779 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Suds3Q8BR65 328 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kif2bQ8C0N1 668 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stk38lQ7TSE6 464 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Lmbrd2Q8C561 694 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Heatr4E9Q357 955 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 SbdsP70122 250 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dcaf17Q3TUL7 519 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Prpf40bQ80W14 870 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Iws1Q8C1D8 766 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Atf7ipQ7TT18 1306 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Serpinb1cQ5SV42 375 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Atp2a1Q8R429 994 aa16.15■□□□□ 0.18
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 1700122O11RikJ3QPW6 241 aa16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mx1P09922 631 aa16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zfp91Q62511 572 aa16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Bicdl2Q8CHW5 507 aa16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Wdr70Q3TWF6 657 aa16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Plcd1Q8R3B1 756 aa16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm5934D3Z4U6 212 aa16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Erich2E9Q1A6 463 aa16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gna11P21278 359 aa16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nub1P54729 614 aa16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa16.14■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zkscan16A2ALW2 728 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Esyt2Q3TZZ7 845 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfm5Q8BU90 496 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Emilin2Q8K482 1074 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sf3a3Q9D554 501 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pak2Q8CIN4 524 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 SnrkQ8VDU5 748 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tab2Q99K90 693 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 SpopQ6ZWS8 374 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ophn1Q99J31 802 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm5935Q497S0 212 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Krit1Q6S5J6 736 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sestd1Q80UK0 696 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Aldh1l2Q8K009 923 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sec63Q8VHE0 760 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gbp5Q8CFB4 590 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ribc1Q9D0B8 379 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 BC005561E9Q5E2 1589 aa16.13■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PpardP35396 440 aa16.12■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ercc5P35689 1170 aa16.12■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Prr29B1ARI9 187 aa16.12■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccdc13D3YV10 709 aa16.12■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zrsr1Q64707 428 aa16.12■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kif17Q99PW8 1038 aa16.12■□□□□ 0.17
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ncoa3O09000 1398 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.8 ms