Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Sox13Q04891 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Sox13Q04891 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sox13Q04891 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Sox13Q04891 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Sox13Q04891 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sox13Q04891 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sox13Q04891 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sox13Q04891 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sox13Q04891 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sox13Q04891 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sox13Q04891 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Sox13Q04891 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sox13Q04891 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Sox13Q04891 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sox13Q04891 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Sox13Q04891 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Sox13Q04891 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sox13Q04891 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sox13Q04891 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Sox13Q04891 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sox13Q04891 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Sox13Q04891 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sox13Q04891 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sox13Q04891 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sox13Q04891 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sox13Q04891 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sox13Q04891 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sox13Q04891 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Sox13Q04891 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sox13Q04891 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sox13Q04891 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Sox13Q04891 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sox13Q04891 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sox13Q04891 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sox13Q04891 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Sox13Q04891 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sox13Q04891 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Sox13Q04891 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sox13Q04891 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sox13Q04891 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sox13Q04891 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sox13Q04891 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sox13Q04891 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sox13Q04891 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sox13Q04891 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sox13Q04891 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sox13Q04891 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sox13Q04891 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sox13Q04891 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sox13Q04891 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sox13Q04891 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sox13Q04891 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sox13Q04891 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sox13Q04891 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sox13Q04891 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sox13Q04891 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sox13Q04891 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sox13Q04891 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sox13Q04891 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sox13Q04891 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sox13Q04891 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sox13Q04891 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Sox13Q04891 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sox13Q04891 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sox13Q04891 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sox13Q04891 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sox13Q04891 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sox13Q04891 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sox13Q04891 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sox13Q04891 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sox13Q04891 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Sox13Q04891 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sox13Q04891 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sox13Q04891 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sox13Q04891 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sox13Q04891 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sox13Q04891 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sox13Q04891 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sox13Q04891 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sox13Q04891 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sox13Q04891 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Sox13Q04891 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sox13Q04891 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sox13Q04891 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox13Q04891 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sox13Q04891 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sox13Q04891 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sox13Q04891 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox13Q04891 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox13Q04891 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox13Q04891 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sox13Q04891 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sox13Q04891 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox13Q04891 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox13Q04891 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox13Q04891 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sox13Q04891 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sox13Q04891 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sox13Q04891 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms