Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,76■■■■□ 3,96
Dcaf17Q3TUL7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Dcaf17Q3TUL7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
Dcaf17Q3TUL7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Dcaf17Q3TUL7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Dcaf17Q3TUL7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Dcaf17Q3TUL7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,34■■■■□ 3,25
Dcaf17Q3TUL7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Dcaf17Q3TUL7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,69■■■■□ 3,14
Dcaf17Q3TUL7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,64■■■■□ 3,14
Dcaf17Q3TUL7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,19■■■■□ 3,06
Dcaf17Q3TUL7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Dcaf17Q3TUL7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Dcaf17Q3TUL7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,01■■■■□ 3,03
Dcaf17Q3TUL7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Dcaf17Q3TUL7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Dcaf17Q3TUL7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Dcaf17Q3TUL7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Dcaf17Q3TUL7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Dcaf17Q3TUL7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Dcaf17Q3TUL7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Dcaf17Q3TUL7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Dcaf17Q3TUL7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,29■■■□□ 2,92
Dcaf17Q3TUL7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Dcaf17Q3TUL7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Dcaf17Q3TUL7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Dcaf17Q3TUL7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Dcaf17Q3TUL7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Dcaf17Q3TUL7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,07■■■□□ 2,88
Dcaf17Q3TUL7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
Dcaf17Q3TUL7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Dcaf17Q3TUL7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Dcaf17Q3TUL7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Dcaf17Q3TUL7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Dcaf17Q3TUL7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Dcaf17Q3TUL7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Dcaf17Q3TUL7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,45■■■□□ 2,79
Dcaf17Q3TUL7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,44■■■□□ 2,78
Dcaf17Q3TUL7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Dcaf17Q3TUL7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Dcaf17Q3TUL7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Dcaf17Q3TUL7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,13■■■□□ 2,73
Dcaf17Q3TUL7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Dcaf17Q3TUL7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Dcaf17Q3TUL7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Dcaf17Q3TUL7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Dcaf17Q3TUL7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Dcaf17Q3TUL7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Dcaf17Q3TUL7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Dcaf17Q3TUL7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Dcaf17Q3TUL7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,55■■■□□ 2,64
Dcaf17Q3TUL7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Dcaf17Q3TUL7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Dcaf17Q3TUL7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Dcaf17Q3TUL7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Dcaf17Q3TUL7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Dcaf17Q3TUL7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Dcaf17Q3TUL7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Dcaf17Q3TUL7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,24■■■□□ 2,59
Dcaf17Q3TUL7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,22■■■□□ 2,59
Dcaf17Q3TUL7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Dcaf17Q3TUL7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,19■■■□□ 2,58
Dcaf17Q3TUL7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Dcaf17Q3TUL7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Dcaf17Q3TUL7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Dcaf17Q3TUL7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Dcaf17Q3TUL7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Dcaf17Q3TUL7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Dcaf17Q3TUL7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,04■■■□□ 2,56
Dcaf17Q3TUL7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Dcaf17Q3TUL7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Dcaf17Q3TUL7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
Dcaf17Q3TUL7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Dcaf17Q3TUL7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Dcaf17Q3TUL7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Dcaf17Q3TUL7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Dcaf17Q3TUL7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Dcaf17Q3TUL7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Dcaf17Q3TUL7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Dcaf17Q3TUL7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,59■■■□□ 2,49
Dcaf17Q3TUL7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Dcaf17Q3TUL7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Dcaf17Q3TUL7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Dcaf17Q3TUL7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Dcaf17Q3TUL7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Dcaf17Q3TUL7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Dcaf17Q3TUL7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Dcaf17Q3TUL7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Dcaf17Q3TUL7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Dcaf17Q3TUL7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Dcaf17Q3TUL7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Dcaf17Q3TUL7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Dcaf17Q3TUL7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Dcaf17Q3TUL7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Dcaf17Q3TUL7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Dcaf17Q3TUL7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Dcaf17Q3TUL7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Dcaf17Q3TUL7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Dcaf17Q3TUL7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,25■■■□□ 2,43
Dcaf17Q3TUL7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,5 ms