Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Becn2P0DM65 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,71■■■■□ 3,31
Becn2P0DM65 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Becn2P0DM65 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Becn2P0DM65 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,16■■■■□ 3,06
Becn2P0DM65 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Becn2P0DM65 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Becn2P0DM65 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Becn2P0DM65 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Becn2P0DM65 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Becn2P0DM65 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Becn2P0DM65 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Becn2P0DM65 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Becn2P0DM65 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Becn2P0DM65 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,29■■■□□ 2,76
Becn2P0DM65 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
Becn2P0DM65 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
Becn2P0DM65 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Becn2P0DM65 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Becn2P0DM65 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Becn2P0DM65 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Becn2P0DM65 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,76■■■□□ 2,67
Becn2P0DM65 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Becn2P0DM65 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Becn2P0DM65 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Becn2P0DM65 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Becn2P0DM65 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Becn2P0DM65 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Becn2P0DM65 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,3■■■□□ 2,6
Becn2P0DM65 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Becn2P0DM65 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Becn2P0DM65 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Becn2P0DM65 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,15■■■□□ 2,58
Becn2P0DM65 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,57
Becn2P0DM65 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Becn2P0DM65 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
Becn2P0DM65 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Becn2P0DM65 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Becn2P0DM65 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Becn2P0DM65 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Becn2P0DM65 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Becn2P0DM65 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,6■■■□□ 2,49
Becn2P0DM65 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Becn2P0DM65 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Becn2P0DM65 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Becn2P0DM65 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,5■■■□□ 2,47
Becn2P0DM65 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Becn2P0DM65 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Becn2P0DM65 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Becn2P0DM65 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Becn2P0DM65 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Becn2P0DM65 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Becn2P0DM65 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Becn2P0DM65 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Becn2P0DM65 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Becn2P0DM65 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Becn2P0DM65 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Becn2P0DM65 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Becn2P0DM65 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Becn2P0DM65 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,95■■■□□ 2,39
Becn2P0DM65 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,88■■■□□ 2,37
Becn2P0DM65 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Becn2P0DM65 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Becn2P0DM65 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Becn2P0DM65 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Becn2P0DM65 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Becn2P0DM65 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Becn2P0DM65 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Becn2P0DM65 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Becn2P0DM65 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Becn2P0DM65 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Becn2P0DM65 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Becn2P0DM65 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Becn2P0DM65 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Becn2P0DM65 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Becn2P0DM65 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Becn2P0DM65 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Becn2P0DM65 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Becn2P0DM65 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Becn2P0DM65 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Becn2P0DM65 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Becn2P0DM65 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Becn2P0DM65 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Becn2P0DM65 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Becn2P0DM65 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Becn2P0DM65 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Becn2P0DM65 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Becn2P0DM65 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Becn2P0DM65 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Becn2P0DM65 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Becn2P0DM65 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Becn2P0DM65 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Becn2P0DM65 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Becn2P0DM65 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Becn2P0DM65 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Becn2P0DM65 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Becn2P0DM65 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Becn2P0DM65 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Becn2P0DM65 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Becn2P0DM65 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms