RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	TSPAN4	O14817	238 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	GNG7	O60262	68 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	OR4E1	P0C645	316 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	SNCA	P37840	140 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	OPRK1	P41145	380 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	DEFB1	P60022	68 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF90	Q03938	601 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	ARL16	Q0P5N6	197 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	TRIQK	Q629K1	86 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	DTD1	Q8TEA8	209 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	ACY3	Q96HD9	319 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	ATP6V0B	Q99437	205 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	VSIR	Q9H7M9	311 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	TUBA4B	Q9H853	241 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	DNAH2	Q9P225	4427 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048		H3BP45	60 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	WRB	O00258	174 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	CCS	O14618	274 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	LYRM1	O43325	122 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	ATG12	O94817	140 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	IFNA10	P01566	189 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	PSG1	P11464	419 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	NPY1R	P25929	384 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	CRYBB3	P26998	211 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	OR10J1	P30954	320 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	HTR2B	P41595	481 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	NPBWR1	P48145	328 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	AP3S2	P59780	193 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	GAMT	Q14353	236 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	LEMD1	Q68G75	181 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	TCF24	Q7RTU0	167 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	LYG2	Q86SG7	212 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	OR1S1	Q8NH92	325 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	MARC2	Q969Z3	335 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	PALMD	Q9NP74	551 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	ENY2	Q9NPA8	101 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM2-234	ENST00000546048	KNCN	A6PVL3	124 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	CYB5B	O43169	146 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	TCRB	P04435	133 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SLC25A6	P12236	298 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	PTTG1IP	P53801	180 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	OR2F1	Q13607	317 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	CASC10	Q5T4H9	136 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	DCANP1	Q8TF63	244 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	MITD1	Q8WV92	249 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	GLMP	Q8WWB7	406 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048		U3KQ87	197 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048		K7EQG2	157 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SYNGR2	O43760	224 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	SIX6	O95475	246 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	TOMM40	O96008	361 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM2-234	ENST00000546048	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82

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