RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr403Q7TRX2 313 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem106bQ80X71 275 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp459Q8BZ17 267 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem41bQ8K1A5 291 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scgb2b27Q8R1E9 112 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr530Q8VFE8 307 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sfxn3Q91V61 321 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab27bQ99P58 218 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MmachcQ9CZD0 279 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col27a1Q5QNQ9 1845 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrgpra9A0A140T8U8 332 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm45800A0A1B0GT24 152 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm36864A0A1Y7VJE6 447 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm12666A2AMD0 254 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1496B9EHG2 317 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21788J3QNH3 180 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps16P14131 146 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hnf1aP22361 628 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp36P22893 319 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lhx4P53776 390 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Otx2P80206 289 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Npy1rQ04573 382 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trat1Q3UU67 187 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm1527Q3V0P3 650 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ParlQ5XJY4 377 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr139Q60891 315 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CybaQ61462 192 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vstm2lQ6PDS0 220 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr153Q8K0Z9 631 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1269Q8VEZ2 309 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr523Q8VFE7 317 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr362Q8VGV7 317 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nkx6-1Q99MA9 365 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl51Q9CPY1 128 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl49Q9CQ40 166 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnmb2Q9CZM9 235 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr945Q9EQB5 319 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cfap46E9Q2C0 2641 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usf3B2RUQ2 2221 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bdp1Q571C7 2467 aa5.6□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H2-M5A7VMS3 348 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr196E9PYP4 309 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf431E9QAG8 526 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Esp8F7AMQ8 149 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01728 117 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PpiaP17742 164 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem256Q5F285 113 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rtp3Q5QGU6 474 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Morn2Q6UL01 79 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Onecut2Q6XBJ3 505 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map6Q7TSJ2 906 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aadacl4Q8BM81 407 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr469Q8VF66 314 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr114Q923Q8 312 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Flywch2Q9CQE9 139 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mettl21AQ9CQL0 218 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyb5r3Q9DCN2 301 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Opn4Q9QXZ9 521 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv4-50A0A0B4J1J0 117 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fkbp8O35465 402 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adcyap1O70176 175 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01803 113 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ctdsp1P58466 261 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl23P62830 140 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Otx1P80205 355 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serf2P84102 59 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MpgQ04841 333 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psmb6Q60692 238 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr141Q60880 325 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1386Q7TQT0 309 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IdnkQ8R0J8 184 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RfxapQ8VCG9 231 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr960Q8VET5 316 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr803Q8VFI3 308 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1443Q8VFW8 312 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mpv17lQ99MS3 194 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcnx2Q5DU28 2122 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PkdrejQ9Z0T6 2126 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp407G3UVV3 2246 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dmxl1Q6PNC0 3013 aa5.59□□□□□ -1.51
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv14-100A0A0G2JG36 117 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc29A0A1B0GQY9 621 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm14548E9Q1Z6 680 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pwwp2bE9Q9M8 600 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r34G3XA52 309 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm28051J3QMA2 81 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21834J3QN05 151 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1053L7MU59 313 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnfsf8P32972 239 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Id3P41133 119 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tff1Q08423 87 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BC147527Q3V185 167 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf664Q4VA44 261 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr987Q7TRA2 309 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr907Q7TRC7 310 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifna13Q80SU4 189 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EtdQ80SW5 59 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc25a41Q8BVN7 312 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EogtQ8BYW9 527 aa5.59□□□□□ -1.52
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AmtQ8CFA2 403 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.8 ms