Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Mrpl49Q9CQ40 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Mrpl49Q9CQ40 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Mrpl49Q9CQ40 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Mrpl49Q9CQ40 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Mrpl49Q9CQ40 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Mrpl49Q9CQ40 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mrpl49Q9CQ40 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mrpl49Q9CQ40 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mrpl49Q9CQ40 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mrpl49Q9CQ40 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Mrpl49Q9CQ40 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mrpl49Q9CQ40 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Mrpl49Q9CQ40 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mrpl49Q9CQ40 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Mrpl49Q9CQ40 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mrpl49Q9CQ40 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mrpl49Q9CQ40 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mrpl49Q9CQ40 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mrpl49Q9CQ40 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mrpl49Q9CQ40 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Mrpl49Q9CQ40 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Mrpl49Q9CQ40 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mrpl49Q9CQ40 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mrpl49Q9CQ40 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mrpl49Q9CQ40 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mrpl49Q9CQ40 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Mrpl49Q9CQ40 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Mrpl49Q9CQ40 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mrpl49Q9CQ40 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Mrpl49Q9CQ40 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mrpl49Q9CQ40 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mrpl49Q9CQ40 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mrpl49Q9CQ40 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mrpl49Q9CQ40 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Mrpl49Q9CQ40 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mrpl49Q9CQ40 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mrpl49Q9CQ40 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mrpl49Q9CQ40 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mrpl49Q9CQ40 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mrpl49Q9CQ40 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mrpl49Q9CQ40 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mrpl49Q9CQ40 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mrpl49Q9CQ40 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mrpl49Q9CQ40 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mrpl49Q9CQ40 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Mrpl49Q9CQ40 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mrpl49Q9CQ40 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mrpl49Q9CQ40 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mrpl49Q9CQ40 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mrpl49Q9CQ40 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mrpl49Q9CQ40 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mrpl49Q9CQ40 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Mrpl49Q9CQ40 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mrpl49Q9CQ40 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mrpl49Q9CQ40 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Mrpl49Q9CQ40 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mrpl49Q9CQ40 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mrpl49Q9CQ40 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mrpl49Q9CQ40 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mrpl49Q9CQ40 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Mrpl49Q9CQ40 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mrpl49Q9CQ40 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Mrpl49Q9CQ40 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mrpl49Q9CQ40 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mrpl49Q9CQ40 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Mrpl49Q9CQ40 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mrpl49Q9CQ40 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mrpl49Q9CQ40 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mrpl49Q9CQ40 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mrpl49Q9CQ40 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mrpl49Q9CQ40 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mrpl49Q9CQ40 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mrpl49Q9CQ40 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Mrpl49Q9CQ40 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mrpl49Q9CQ40 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mrpl49Q9CQ40 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mrpl49Q9CQ40 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mrpl49Q9CQ40 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mrpl49Q9CQ40 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mrpl49Q9CQ40 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mrpl49Q9CQ40 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mrpl49Q9CQ40 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mrpl49Q9CQ40 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mrpl49Q9CQ40 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mrpl49Q9CQ40 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mrpl49Q9CQ40 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mrpl49Q9CQ40 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mrpl49Q9CQ40 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl49Q9CQ40 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mrpl49Q9CQ40 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mrpl49Q9CQ40 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl49Q9CQ40 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mrpl49Q9CQ40 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mrpl49Q9CQ40 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mrpl49Q9CQ40 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Mrpl49Q9CQ40 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mrpl49Q9CQ40 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
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