RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	OR5B12	Q96R08	314 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	PRND	Q9UKY0	176 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744		A0A0B4J2A0	478 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	NUDT19	A8MXV4	375 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	CCS	O14618	274 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IFNA17	P01571	189 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV3-11	P01762	117 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IGHG4	P01861	327 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	TRGV3	P03979	118 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	TPPP2	P59282	170 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SRPX	P78539	464 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	FOXE3	Q13461	319 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	NMS	Q5H8A3	153 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	TEX38	Q6PEX7	206 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM65	Q6PI78	240 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	COQ8A	Q8NI60	647 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IL22RA2	Q969J5	263 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	DUX3	Q96PT4	197 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SPIN2A	Q99865	258 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	GON7	Q9BXV9	100 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	GNB4	Q9HAV0	340 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF580	Q9UK33	172 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744		S4R3C0	116 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ANK2	Q01484	3957 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	MPTX1	A8MV57	137 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	OR2J3	O76001	311 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	TSPAN15	O95858	294 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IGLV1-40	P01703	118 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ELANE	P08246	267 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	OR13C7	P0DN81	318 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	PSMB8	P28062	276 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	PSMB6	P28072	239 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	RAB9A	P51151	201 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	PRCD	Q00LT1	54 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	CD83	Q01151	205 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	WT1-AS	Q06250	92 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	DEFB136	Q30KP8	78 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	PLET1	Q6UQ28	207 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	COMMD1	Q8N668	190 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	OR1S1	Q8NH92	325 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	FAM25E	A8MYX2	175 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	IGHV3-23	P01764	117 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	FGF2	P09038	288 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	RHOG	P84095	191 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SMCO1	Q147U7	214 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	CADM3	Q8N126	398 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	LRTM2	Q8N967	370 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	OR5B3	Q8NH48	314 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	MITD1	Q8WV92	249 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	PALMD	Q9NP74	551 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ENY2	Q9NPA8	101 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	NDUFB8	O95169	186 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RPL4-208	ENST00000564744	SCGB1D2	O95969	90 aa		6.6	□□□□□ -1.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms