RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500576.4

LYRM4-208, Transcript of LYR motif containing 4, human

TSL 2 BASIC

Gene LYRM4, Length 592 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYRM4-208	ENST00000500576	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	MLX	Q9UH92	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	PHOX2A	O14813	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	SLC31A2	O15432	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	SPRY3	O43610	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	YIF1A	O95070	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	CD1B	P29016	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	OPRK1	P41145	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	PSMB3	P49720	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	DLX6	P56179	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	CD81	P60033	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	RAB5B	P61020	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	EFNB3	Q15768	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	SSX2	Q16385	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	S1PR3	Q99500	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	SSX3	Q99909	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	IGF2R	P11717	2491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576		A0A1W2PPE2	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576		M0R1X1	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	UPK2	O00526	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	CYB5B	O43169	146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	TGOLN2	O43493	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	FCGR3B	O75015	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	MMP23A	O75900	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	TSPAN9	O75954	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	HRAS	P01112	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	IFNA1	P01562	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	FBP1	P09467	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	SELL	P14151	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	IRF2	P14316	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	DAO	P14920	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	OR2B8P	P59922	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	FAM201A	Q5SY85	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	PNKD	Q8N490	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LYRM4-208	ENST00000500576	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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