RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, human

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRU-210	ENST00000527027	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	RAB6A	P20340	208 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	DTYMK	P23919	212 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	MYL9	P24844	172 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	APOC4	P55056	127 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	OR4S2	Q8NH73	311 aa		11.99	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	HERC2	O95714	4834 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	IFITM5	A6NNB3	132 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	PDCD5	O14737	125 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	IGLV2-14	P01704	120 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	ARL6IP1	Q15041	203 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	ZNF585B	Q52M93	769 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	OR2C3	Q8N628	320 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	CXorf58	Q96LI9	332 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	UBE2C	O00762	179 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	DEFA4	P12838	97 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	TMBIM6	P55061	237 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	OR10A3	P58181	314 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	CDNF	Q49AH0	187 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	SPATA2	Q9UM82	520 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	TMEM127	O75204	238 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	HRAS	P01112	189 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	REG1A	P05451	166 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	DEFB135	Q30KP9	77 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	MFSD4A	Q8N468	514 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	BATF3	Q9NR55	127 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PTPRU-210	ENST00000527027	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	GABARAP	O95166	117 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	GPR107	Q5VW38	600 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	CNIH2	Q6PI25	160 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	SSX9	Q7RTT3	188 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	STPG3	Q8N7X2	389 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	RNF183	Q96D59	192 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	CGB1	A6NKQ9	187 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	MYOD1	P15172	320 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	HLA-G	P17693	338 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	GPR183	P32249	361 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	HACD4	Q5VWC8	232 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	C22orf42	Q6IC83	251 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	PLET1	Q6UQ28	207 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	OR4A5	Q8NH83	315 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	TSPAN4	O14817	238 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	RAB3B	P20337	219 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	OR2B8P	P59922	312 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	BET1L	Q9NYM9	111 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	THYN1	Q9P016	225 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	CCDC160	A6NGH7	325 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	DEDD	O75618	318 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PTPRU-210	ENST00000527027	GPHA2	Q96T91	129 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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